52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3460 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  295  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  97.76 
 
 
145 aa  273  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  80.14 
 
 
145 aa  239  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  60.14 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  60.14 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  60.43 
 
 
146 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  59.57 
 
 
145 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  45.27 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  43.92 
 
 
158 aa  129  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  44.44 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  45.59 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  47.97 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  43.92 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  41.89 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  45.59 
 
 
163 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  43.15 
 
 
158 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  51.75 
 
 
154 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  42.65 
 
 
166 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  44.12 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  48.55 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  42.65 
 
 
166 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  42.65 
 
 
166 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  44.12 
 
 
164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  42.65 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  44.44 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  44.12 
 
 
164 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  40.54 
 
 
166 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  45.07 
 
 
161 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  41.26 
 
 
157 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  50.6 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  51.19 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  36.7 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  26.87 
 
 
230 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  36.92 
 
 
162 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  31.43 
 
 
173 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  34.72 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  27.12 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  29.91 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  26.27 
 
 
244 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4019  hypothetical protein  28.78 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4135  hypothetical protein  29.5 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  28.12 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4161  hypothetical protein  28.78 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  27.71 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  30.84 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.99 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>