20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4161 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4161  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4019  hypothetical protein  94.61 
 
 
167 aa  315  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4135  hypothetical protein  95.68 
 
 
173 aa  308  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0407  hypothetical protein  70.59 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.130263  normal  0.0951666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003422  hypothetical protein  43.48 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02356  hypothetical protein  43.48 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1112  hypothetical protein  41.3 
 
 
158 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0448  hypothetical protein  36.88 
 
 
157 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0424  hypothetical protein  37.68 
 
 
157 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0193  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09568  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.529337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1416  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  34.29 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  28.74 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  28.78 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  30.12 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  29.2 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
168 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>