44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3083 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  347  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  347  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  99.4 
 
 
166 aa  346  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  99.4 
 
 
166 aa  345  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  91.41 
 
 
164 aa  315  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  90.8 
 
 
164 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  90.18 
 
 
164 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  90.12 
 
 
163 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  83.23 
 
 
159 aa  279  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  77.64 
 
 
166 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  78.98 
 
 
158 aa  267  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  81.17 
 
 
158 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  78.57 
 
 
158 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  73.89 
 
 
158 aa  253  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  75 
 
 
158 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  74.84 
 
 
156 aa  250  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  61.74 
 
 
153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  193  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  48.68 
 
 
154 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  43.85 
 
 
146 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  42.65 
 
 
143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  38.62 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  38.62 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  38.62 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  38.62 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  38.62 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  38.62 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  41.79 
 
 
145 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  39.1 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  42.54 
 
 
145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  40.67 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  40.4 
 
 
155 aa  111  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  39.47 
 
 
161 aa  107  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  32.47 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1398  hypothetical protein  100 
 
 
30 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  28.83 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  27.13 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  26.49 
 
 
244 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  25.66 
 
 
238 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  25.56 
 
 
230 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  31.52 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>