129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3120 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
374 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  52.31 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  50.15 
 
 
423 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  49.85 
 
 
334 aa  315  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  43.84 
 
 
498 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  42.65 
 
 
489 aa  279  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  43.21 
 
 
500 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  43.31 
 
 
488 aa  275  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  41.03 
 
 
474 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  43.9 
 
 
496 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  44.8 
 
 
547 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  43.49 
 
 
516 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  41.47 
 
 
485 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  40.6 
 
 
483 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  43.62 
 
 
484 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  43.52 
 
 
478 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  39.17 
 
 
487 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  38.19 
 
 
497 aa  239  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  42.69 
 
 
482 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  42.9 
 
 
487 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  42.72 
 
 
513 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  36.02 
 
 
486 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  35.42 
 
 
486 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 
511 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  36.02 
 
 
486 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 
487 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  36.91 
 
 
389 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  37.17 
 
 
393 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  35.29 
 
 
399 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  35.11 
 
 
396 aa  170  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  33.55 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  35.35 
 
 
341 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 
374 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  31.91 
 
 
368 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 
374 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.41 
 
 
349 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.02 
 
 
375 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  33 
 
 
365 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.38 
 
 
366 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.47 
 
 
346 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  33.56 
 
 
346 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  29.62 
 
 
355 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  32.21 
 
 
347 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  34.22 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  30.75 
 
 
408 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.42 
 
 
335 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  29.96 
 
 
346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  28.52 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  28.78 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  30.03 
 
 
351 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  31.43 
 
 
420 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.76 
 
 
427 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  29.78 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  29.51 
 
 
420 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  30 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  28.37 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  24.29 
 
 
335 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.13 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.57 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  25.53 
 
 
669 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.16 
 
 
892 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  26.7 
 
 
324 aa  62.8  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  27.1 
 
 
652 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  27.1 
 
 
652 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  26.59 
 
 
667 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  25.87 
 
 
675 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  24.68 
 
 
898 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  25.88 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  26.85 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  26.3 
 
 
875 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  25 
 
 
669 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.33 
 
 
905 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  25.97 
 
 
875 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  22.7 
 
 
883 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  25.34 
 
 
654 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  24.07 
 
 
875 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  26.37 
 
 
660 aa  50.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  23.58 
 
 
667 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  28.34 
 
 
880 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  26.38 
 
 
339 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  23.23 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  26.61 
 
 
655 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.95 
 
 
888 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  24.24 
 
 
1077 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  26.19 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  25.49 
 
 
904 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 
863 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  24.14 
 
 
863 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  25.16 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  24.07 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  24.7 
 
 
880 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0332  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  31.07 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.0219127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  22.75 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.01 
 
 
877 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  26.01 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  25.08 
 
 
335 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  26.88 
 
 
339 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  26.63 
 
 
672 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  23.49 
 
 
684 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  27.6 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>