91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2403 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
365 aa  757    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  67.35 
 
 
341 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  55.25 
 
 
420 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  57.62 
 
 
335 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  54.47 
 
 
346 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  49.23 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  44.25 
 
 
351 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  44.26 
 
 
324 aa  265  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  34.33 
 
 
498 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 
478 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  34.36 
 
 
488 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
500 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  33 
 
 
374 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 
483 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  34.26 
 
 
496 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  34.52 
 
 
349 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  31.18 
 
 
474 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
511 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  31.17 
 
 
487 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  28.98 
 
 
486 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.17 
 
 
375 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  29.3 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  32.39 
 
 
516 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  29.3 
 
 
486 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  30.34 
 
 
374 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  34.27 
 
 
513 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  30.34 
 
 
368 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  30.34 
 
 
374 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 
489 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 
547 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  33.64 
 
 
484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  32.05 
 
 
346 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  30.99 
 
 
360 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 
482 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  29.6 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.7 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.92 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  28.81 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  28.87 
 
 
497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  30.08 
 
 
355 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  29 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  28.24 
 
 
423 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  25.82 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  26.26 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  25.7 
 
 
335 aa  96.3  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  25.94 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  25.34 
 
 
420 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  24.41 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  25.89 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  26.14 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  26.14 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.14 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  24.39 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  23.62 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  25.5 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  24.54 
 
 
669 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0785  inorganic diphosphatase  29.52 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  22.57 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  29.41 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  21.7 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  26.07 
 
 
672 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  23.15 
 
 
667 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  26.37 
 
 
657 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  25.42 
 
 
657 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01960  exopolyphosphatase, putative  30.6 
 
 
502 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.136857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  27.87 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  24.92 
 
 
660 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  26.37 
 
 
657 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  26.06 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  26.37 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  26.37 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  26.37 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  26.37 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.24 
 
 
873 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  24 
 
 
655 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3754  phosphoesterase domain-containing protein  38.46 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0331938  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.09 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  25.98 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  25.6 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  26.37 
 
 
657 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  26.37 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  23.9 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  26.18 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.13 
 
 
658 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0206  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.07 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.773768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.37 
 
 
658 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  23.98 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  27.92 
 
 
337 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  27.05 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>