197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1267 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  100 
 
 
312 aa  648    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  72.44 
 
 
313 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  72.44 
 
 
313 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  49.83 
 
 
310 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  49.83 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  49.5 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  49.5 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  49.5 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  49.5 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  49.5 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  48.51 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  49.5 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  49.16 
 
 
310 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  48.83 
 
 
356 aa  299  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  45.81 
 
 
315 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  46.69 
 
 
315 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0777  hypothetical protein  44.01 
 
 
307 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0789  DHH family protein  45.1 
 
 
325 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0537  DHH family protein  41.1 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000764384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  42.26 
 
 
319 aa  241  9e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  41.37 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  37.38 
 
 
314 aa  207  2e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1286  phosphoesterase, DHH family protein  38.36 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  36.84 
 
 
339 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl636  exopolyphosphatase-like  32.06 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0142  DHH phosphoesterase family protein, putative  29.18 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.457819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  32.23 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  31.89 
 
 
317 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  28 
 
 
316 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf831  DHH family phosphoesterase  31.68 
 
 
325 aa  133  5e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  31.67 
 
 
318 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  30.51 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  31.31 
 
 
314 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  30.42 
 
 
351 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  26.86 
 
 
366 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  30.75 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  29.63 
 
 
343 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  26.54 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  28.75 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  30.53 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  27.52 
 
 
320 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  30.85 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  27.76 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  25.93 
 
 
324 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  25.97 
 
 
335 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  30.65 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  25.98 
 
 
318 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  28.08 
 
 
344 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  30.03 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  29.28 
 
 
336 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  26.58 
 
 
318 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  26.07 
 
 
326 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  28.06 
 
 
353 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  25 
 
 
330 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  29.21 
 
 
332 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  25.77 
 
 
322 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  25.57 
 
 
326 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  28.34 
 
 
346 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  26.53 
 
 
322 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  27.54 
 
 
323 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  28.48 
 
 
331 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  26.8 
 
 
331 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  25.24 
 
 
336 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  24.68 
 
 
325 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  26.05 
 
 
335 aa  99.4  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  26.4 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  26.2 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  28.64 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  26.86 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  23.24 
 
 
386 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  26.32 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  25.4 
 
 
352 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  25.57 
 
 
353 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  26 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0462  DHH family protein  24.12 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  25.66 
 
 
326 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  26.63 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  26.39 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.12 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  26.35 
 
 
333 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  26.35 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  27.18 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  25.08 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  26.28 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.3 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  24 
 
 
330 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  23.97 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  27.01 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  24.33 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  27.53 
 
 
334 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  28.57 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  23.77 
 
 
334 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  29.65 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  23.48 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  24.91 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  23.61 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  25.43 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  25.33 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.18 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  25.34 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>