227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3559 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  100 
 
 
386 aa  757    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  75.47 
 
 
364 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  52.74 
 
 
332 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3328  phosphoesterase RecJ domain protein  49.52 
 
 
350 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.506881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1373  phosphoesterase domain-containing protein  52.12 
 
 
348 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796357  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1064  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  50.16 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  0.0224811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  48.53 
 
 
336 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1330  phosphoesterase domain-containing protein  50.79 
 
 
347 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466207  hitchhiker  0.00483796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  49.82 
 
 
357 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  45.1 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  45.1 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  45.9 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  45.1 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2154  phosphoesterase RecJ domain protein  44.12 
 
 
320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2210  phosphoesterase RecJ domain protein  47.54 
 
 
340 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00226161  decreased coverage  0.000527664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  44.08 
 
 
336 aa  206  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4037  phosphoesterase domain-containing protein  44.41 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.458843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  33.44 
 
 
332 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  37.66 
 
 
326 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  37.25 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  37.72 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  35.56 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  32.06 
 
 
318 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  31.95 
 
 
326 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  38.57 
 
 
325 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  34.41 
 
 
326 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1718  phosphoesterase RecJ domain protein  37.14 
 
 
314 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.073164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  37 
 
 
322 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  32.59 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  35.69 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  37.76 
 
 
331 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  33.13 
 
 
351 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  37.5 
 
 
330 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  38.61 
 
 
335 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  38.22 
 
 
338 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.89 
 
 
318 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  31.29 
 
 
324 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  30.04 
 
 
317 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  33.23 
 
 
333 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  30.17 
 
 
326 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  30.72 
 
 
333 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  35.02 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  37.1 
 
 
358 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  28.36 
 
 
335 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  32.78 
 
 
325 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  32.2 
 
 
332 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  31.58 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  33.23 
 
 
330 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09380  exopolyphosphatase-like enzyme  35.06 
 
 
336 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  32.08 
 
 
317 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  34 
 
 
320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  26.25 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  35.71 
 
 
330 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  31.13 
 
 
317 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  34.74 
 
 
339 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  31.23 
 
 
318 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  34.25 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  33.44 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  34.43 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.72 
 
 
320 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  30.55 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  29.26 
 
 
336 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  32.76 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  28.38 
 
 
333 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  31.95 
 
 
337 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  34.2 
 
 
353 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  33.21 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.371885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  33.77 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  30.62 
 
 
316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 
352 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  28.18 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  33.87 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  34.32 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  30.82 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  31.01 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  29.43 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  31.83 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  30.61 
 
 
346 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  27.95 
 
 
336 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  33.74 
 
 
354 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  27.64 
 
 
331 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  30.82 
 
 
331 aa  122  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  31.23 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 
330 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1671  phosphoesterase RecJ domain protein  32.19 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00108699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0965  phosphoesterase domain-containing protein  31.07 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0127219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  32.85 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  33.57 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  28.57 
 
 
331 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  30.31 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  30.7 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  27.65 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  30.16 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0057  phosphoesterase RecJ domain protein  31.74 
 
 
369 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  28.87 
 
 
316 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1414  phosphoesterase, RecJ-like protein  34.65 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  29.69 
 
 
322 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2816  phosphoesterase domain-containing protein  30.08 
 
 
338 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 
344 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>