190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2979 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  98.14 
 
 
322 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
322 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  68.05 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  65.38 
 
 
316 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  65.06 
 
 
316 aa  381  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0965  phosphoesterase domain-containing protein  60.19 
 
 
319 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0127219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1671  phosphoesterase RecJ domain protein  57.19 
 
 
321 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00108699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  51.9 
 
 
318 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  37.54 
 
 
323 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  37.97 
 
 
326 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  38.41 
 
 
318 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  35.78 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  34.19 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  33.87 
 
 
317 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  36.94 
 
 
331 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  34.29 
 
 
320 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  35.24 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  31.09 
 
 
326 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  38.83 
 
 
322 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  35.12 
 
 
339 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  32.69 
 
 
317 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  32.26 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  34.29 
 
 
339 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  36.39 
 
 
335 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  33.55 
 
 
318 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  35.47 
 
 
366 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  33.01 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  34.63 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  34.33 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  32.2 
 
 
355 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  30.74 
 
 
320 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  32.05 
 
 
330 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  29.94 
 
 
324 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  30.84 
 
 
332 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  33.02 
 
 
352 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  30.82 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  34.27 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  31.96 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  30 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  33 
 
 
333 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  30.98 
 
 
334 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  34.39 
 
 
314 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  32.23 
 
 
324 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  31.18 
 
 
331 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  34.65 
 
 
325 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  32.24 
 
 
330 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  30.06 
 
 
354 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  31.25 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  33.55 
 
 
343 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  32.19 
 
 
336 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  32.59 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  31.68 
 
 
336 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  30.36 
 
 
332 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  29.75 
 
 
334 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  30.31 
 
 
386 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  32.33 
 
 
336 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  27.19 
 
 
351 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09380  exopolyphosphatase-like enzyme  35.26 
 
 
336 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0057  phosphoesterase RecJ domain protein  28.85 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  30.67 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  30.32 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  30.37 
 
 
364 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  27.73 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  31.65 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  35.29 
 
 
338 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  29.84 
 
 
353 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  31.51 
 
 
346 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  30.45 
 
 
335 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.77 
 
 
331 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  29.77 
 
 
331 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  29.77 
 
 
331 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2154  phosphoesterase RecJ domain protein  30.69 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4037  phosphoesterase domain-containing protein  31.44 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.458843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  28.92 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  33.02 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  29.78 
 
 
330 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2816  phosphoesterase domain-containing protein  31.45 
 
 
338 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3328  phosphoesterase RecJ domain protein  28.8 
 
 
350 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.506881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  27.63 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  29.38 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  28.9 
 
 
331 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  30.38 
 
 
336 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  27.57 
 
 
313 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  27.57 
 
 
313 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  28.31 
 
 
341 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  29.84 
 
 
334 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  32.99 
 
 
330 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1373  phosphoesterase domain-containing protein  28.52 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796357  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.26 
 
 
335 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  29.32 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.371885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  30.19 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  28.39 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  26.64 
 
 
357 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  29.22 
 
 
330 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  25.95 
 
 
314 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1064  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.07 
 
 
342 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  0.0224811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1718  phosphoesterase RecJ domain protein  28.34 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.073164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1414  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.12 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2210  phosphoesterase RecJ domain protein  31.92 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00226161  decreased coverage  0.000527664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>