172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6028 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
343 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  52.15 
 
 
344 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  48.79 
 
 
346 aa  339  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  47.81 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  47.08 
 
 
336 aa  331  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  42.48 
 
 
334 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  42.12 
 
 
334 aa  275  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  41.61 
 
 
351 aa  266  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  40.13 
 
 
335 aa  255  8e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  38.44 
 
 
336 aa  232  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  36.48 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  42.18 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  35.8 
 
 
353 aa  189  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  36.99 
 
 
355 aa  186  6e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  33.54 
 
 
352 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  34.53 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  33.54 
 
 
318 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  32.52 
 
 
358 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  33.84 
 
 
354 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  32.31 
 
 
353 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  34.92 
 
 
331 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  31.86 
 
 
320 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  28.98 
 
 
317 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  31.08 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  31.15 
 
 
326 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  31.13 
 
 
317 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  30.91 
 
 
317 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  31.56 
 
 
341 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  33.12 
 
 
318 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  31.96 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  31.55 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  31.66 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.22 
 
 
318 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  30.82 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  31.17 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  32.19 
 
 
322 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  31.76 
 
 
323 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  28.44 
 
 
331 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  29.47 
 
 
339 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  32.63 
 
 
316 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  28.47 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  32.73 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  30.64 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  29.63 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  28.04 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  32.37 
 
 
322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  30.18 
 
 
338 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  30.09 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  27.04 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  30.99 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  28.75 
 
 
330 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3328  phosphoesterase RecJ domain protein  30.03 
 
 
350 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.506881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  30.03 
 
 
326 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.41 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0965  phosphoesterase domain-containing protein  30.58 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0127219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  29.19 
 
 
310 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  29.43 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  29.43 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  29.19 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  29.43 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.36 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  30.36 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  28.8 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  30.36 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  29.8 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  29.43 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  31.15 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1671  phosphoesterase RecJ domain protein  31.36 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00108699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  28.96 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  29.43 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  28.96 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  27.42 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  29.11 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  29.19 
 
 
356 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  28.86 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  33.22 
 
 
316 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  27.54 
 
 
326 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1373  phosphoesterase domain-containing protein  30.26 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796357  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  28.97 
 
 
330 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  33.96 
 
 
332 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  29.24 
 
 
336 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  29.25 
 
 
331 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  27.91 
 
 
332 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 
315 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0537  DHH family protein  28.62 
 
 
311 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000764384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  30.65 
 
 
330 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  30.2 
 
 
333 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  27.04 
 
 
314 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  29.87 
 
 
333 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2816  phosphoesterase domain-containing protein  29.71 
 
 
338 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  27.9 
 
 
319 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09380  exopolyphosphatase-like enzyme  29.21 
 
 
336 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  30.42 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1064  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.07 
 
 
342 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  0.0224811 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  29.29 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  28.72 
 
 
315 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  28.35 
 
 
339 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2154  phosphoesterase RecJ domain protein  31.02 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>