178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0539 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
336 aa  698    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  52.71 
 
 
346 aa  352  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  49.4 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  48.92 
 
 
343 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  47.04 
 
 
344 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  48.17 
 
 
336 aa  322  5e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  47.31 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  44.55 
 
 
334 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  42.36 
 
 
335 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  37.92 
 
 
336 aa  238  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  34.7 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  38.93 
 
 
366 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  35.58 
 
 
354 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  34.45 
 
 
353 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  33.97 
 
 
353 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  35.69 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  31.85 
 
 
355 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  31.72 
 
 
352 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  33.01 
 
 
354 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  33.13 
 
 
318 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  31.92 
 
 
318 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  29.61 
 
 
317 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  31.87 
 
 
316 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  30.5 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  28.16 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0965  phosphoesterase domain-containing protein  31.32 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0127219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  28.13 
 
 
326 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 
320 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  27.46 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  29.83 
 
 
322 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  28.61 
 
 
335 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  27.87 
 
 
341 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  30.46 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  30.23 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  28.62 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  27.74 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  31.72 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  29.18 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  27.65 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  27.13 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  25.67 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1671  phosphoesterase RecJ domain protein  29.31 
 
 
321 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00108699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  28.39 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  28.39 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  26.64 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  26.89 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.64 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  30.06 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  27.62 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  31.23 
 
 
316 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  27.83 
 
 
331 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  27.92 
 
 
337 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  26.5 
 
 
338 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  26.47 
 
 
334 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  26.87 
 
 
320 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  25.78 
 
 
334 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.371885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  27.16 
 
 
330 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  26.28 
 
 
310 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.02 
 
 
325 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  28.9 
 
 
322 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  25.24 
 
 
312 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  29.63 
 
 
322 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  26.87 
 
 
356 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  26.92 
 
 
330 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  27.3 
 
 
310 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  26.62 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  26.62 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  26.62 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  26.87 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2816  phosphoesterase domain-containing protein  28.36 
 
 
338 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  32.02 
 
 
357 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  26.62 
 
 
310 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  26.62 
 
 
310 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  26.62 
 
 
310 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.8 
 
 
335 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  29.63 
 
 
315 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  26.62 
 
 
310 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  26.06 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  28.39 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  25.78 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  27.56 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.73 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  28.01 
 
 
339 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09380  exopolyphosphatase-like enzyme  29.37 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  27.87 
 
 
331 aa  96.3  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  33.11 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  26.54 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.23 
 
 
320 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0537  DHH family protein  27.81 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000764384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0057  phosphoesterase RecJ domain protein  29.04 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3328  phosphoesterase RecJ domain protein  26.33 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.506881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  24.25 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  27.84 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0142  DHH phosphoesterase family protein, putative  27.72 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.457819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  27.16 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  24.53 
 
 
314 aa  89  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  25 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  27.01 
 
 
314 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2210  phosphoesterase RecJ domain protein  35.29 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00226161  decreased coverage  0.000527664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  26.52 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>