123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0187 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
391 aa  772    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  57.63 
 
 
393 aa  401  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  54.57 
 
 
389 aa  396  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  57.22 
 
 
396 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  54.47 
 
 
399 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  37.75 
 
 
516 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  36.84 
 
 
498 aa  186  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  35.46 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  33.51 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  39.06 
 
 
513 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  35.76 
 
 
496 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  36.64 
 
 
485 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  38.82 
 
 
478 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  31.78 
 
 
474 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  33.42 
 
 
547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  35.41 
 
 
334 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  33.44 
 
 
374 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  32.31 
 
 
500 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  32.68 
 
 
423 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 
486 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  30.98 
 
 
487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  29.97 
 
 
486 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  33.76 
 
 
497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 
483 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 
486 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 
511 aa  159  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  32.19 
 
 
339 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  31.88 
 
 
487 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  31.51 
 
 
484 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 
487 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 
482 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  29.7 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  29.78 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  29.78 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  29.78 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  30.67 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  33.58 
 
 
420 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  32.47 
 
 
429 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.32 
 
 
346 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  25.86 
 
 
346 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.6 
 
 
420 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  31.6 
 
 
420 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  30.4 
 
 
427 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  30.42 
 
 
393 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  28.47 
 
 
366 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  29.75 
 
 
408 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  25.87 
 
 
360 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  26.74 
 
 
349 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  27.83 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.9 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  23.53 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  26.33 
 
 
324 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  25.32 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  27.41 
 
 
672 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  25.63 
 
 
346 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  22.19 
 
 
341 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  24.86 
 
 
652 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  24.86 
 
 
652 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  24.05 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  26.02 
 
 
669 aa  70.1  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1246  phosphoesterase domain-containing protein  24.92 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631714  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  24.76 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  24.61 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  23.33 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  23.64 
 
 
351 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  29.7 
 
 
658 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  25.28 
 
 
338 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  26.03 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.22 
 
 
892 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  26.01 
 
 
675 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.84 
 
 
658 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0532  Inorganic diphosphatase  29.01 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  24.92 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.42 
 
 
657 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  25.23 
 
 
667 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  26.69 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  26.69 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  26.69 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  26.69 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  26.84 
 
 
685 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  25 
 
 
654 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  26.69 
 
 
657 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  26.69 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.89 
 
 
669 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.69 
 
 
657 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  24.32 
 
 
655 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  23.34 
 
 
654 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  26.38 
 
 
657 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  24.93 
 
 
655 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  24.93 
 
 
655 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  25.85 
 
 
657 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  25.85 
 
 
657 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1946  Inorganic diphosphatase  29.32 
 
 
308 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  23.78 
 
 
684 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0785  inorganic diphosphatase  26.99 
 
 
311 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.32 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  23.53 
 
 
667 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10110  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  31.43 
 
 
311 aa  47  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000656795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.13 
 
 
309 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4078  Inorganic diphosphatase  29.46 
 
 
307 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>