195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0080 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 667 aa  1362    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  62.73 
 
 		 669 aa  862    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  39.08 
 
 		 667 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  39.69 
 
 		 652 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  37.84 
 
 		 684 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  41.57 
 
 		 652 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  37.33 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  36.94 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  38.68 
 
 		 658 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  35.62 
 
 		 655 aa  416  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  34.57 
 
 		 657 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  35.08 
 
 		 657 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  34.51 
 
 		 657 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  34.92 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  34.92 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  34.92 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  34.92 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  35.08 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  34.92 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  34.51 
 
 		 657 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  34.26 
 
 		 657 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  33.68 
 
 		 655 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  33.68 
 
 		 655 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  33.49 
 
 		 672 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  33.69 
 
 		 672 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  35.71 
 
 		 685 aa  343  5e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  31.51 
 
 		 675 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  29.55 
 
 		 660 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  28.35 
 
 		 654 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  31.21 
 
 		 654 aa  257  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  24.83 
 
 		 653 aa  144  4e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  27.07 
 
 		 344 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  26.67 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  27.36 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  28.06 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  29.07 
 
 		 341 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  28.49 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  28.61 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.01 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  24.78 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.96 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  26.97 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 		 902 aa  74.3  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  26.18 
 
 		 324 aa  73.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  25.88 
 
 		 888 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  26.23 
 
 		 904 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  25.48 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  26.16 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  27.27 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  24.7 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  25.16 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  27.3 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  27.85 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  27.62 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  27.78 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  24.47 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  25.87 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  28.29 
 
 		 339 aa  66.6  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  25.23 
 
 		 880 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  24.93 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.75 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  25 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  24.02 
 
 		 898 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.84 
 
 		 892 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  24.92 
 
 		 1077 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  24.69 
 
 		 874 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  24.34 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  25.4 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  26.83 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  25.08 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  25.36 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  22.33 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  26.43 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  21.78 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  30.95 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  25.08 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  24.21 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  24.3 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  29.53 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  27.04 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  24.77 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.6 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  26.75 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  23.3 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  24.49 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  26.04 
 
 		 907 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  22.61 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  24.79 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  26.22 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  24.3 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  24.01 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  23.38 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  26.85 
 
 		 498 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1286  phosphoesterase, DHH family protein  26.44 
 
 		 330 aa  60.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 		 873 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  26.22 
 
 		 486 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  25.08 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.1 
 
 		 821 aa  59.7  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>