168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0011 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  100 
 
 		 672 aa  1372    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  48.39 
 
 		 672 aa  662    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  44.67 
 
 		 675 aa  598  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  43.59 
 
 		 658 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  43.37 
 
 		 657 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  42.88 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  43.03 
 
 		 657 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  42.88 
 
 		 657 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  42.88 
 
 		 657 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  42.88 
 
 		 657 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  42.88 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  42.88 
 
 		 657 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  42.88 
 
 		 657 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  45.24 
 
 		 658 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  42.88 
 
 		 657 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  42.99 
 
 		 657 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  39.91 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  40.49 
 
 		 655 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  40.49 
 
 		 655 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  39.85 
 
 		 655 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  37.44 
 
 		 669 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  34.05 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  33.49 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  34.02 
 
 		 654 aa  363  7.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  35.43 
 
 		 660 aa  361  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  34.41 
 
 		 652 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  34.41 
 
 		 652 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  30.77 
 
 		 669 aa  320  5e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  29.39 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  34.95 
 
 		 684 aa  308  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  26.56 
 
 		 653 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  26.16 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  26.28 
 
 		 335 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  25.95 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  24.37 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  24.16 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.75 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  30.14 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.17 
 
 		 892 aa  64.3  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  24.64 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  25.37 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  24.51 
 
 		 354 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  23.73 
 
 		 351 aa  63.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  24.09 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  24.81 
 
 		 1077 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  26.56 
 
 		 511 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  25.38 
 
 		 356 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  25.38 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  30.17 
 
 		 336 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  25.38 
 
 		 310 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  23.86 
 
 		 353 aa  62  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.26 
 
 		 907 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  25.31 
 
 		 330 aa  62  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  26.92 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  24.79 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  23.87 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  25.08 
 
 		 310 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  25.08 
 
 		 310 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  24.7 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  24.44 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  25.08 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  25.08 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  25.08 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0637  DHH family protein  23.63 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000263818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  25.08 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  25.35 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  24.77 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  26.36 
 
 		 898 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  23.01 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.4 
 
 		 888 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  25.85 
 
 		 874 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  24.36 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  26.02 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  26.63 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  25.15 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  23.47 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  21.43 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  25.07 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  24.24 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  24.87 
 
 		 474 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.52 
 
 		 821 aa  56.2  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  23.97 
 
 		 317 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  26.11 
 
 		 478 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  23.97 
 
 		 317 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  25 
 
 		 872 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  25.21 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 		 486 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  24.37 
 
 		 310 aa  55.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0419  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.69 
 
 		 310 aa  54.3  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  24.55 
 
 		 336 aa  54.3  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1286  phosphoesterase, DHH family protein  26.8 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  24.79 
 
 		 326 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 		 873 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  23.77 
 
 		 333 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  23.78 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  26.34 
 
 		 333 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  23.39 
 
 		 324 aa  52.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>