225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2973 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  100 
 
 		 652 aa  1293    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  99.69 
 
 		 652 aa  1289    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  43.19 
 
 		 669 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  39.53 
 
 		 667 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  36.81 
 
 		 684 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  38.18 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  37.87 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  37.87 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  37.87 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  37.87 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  37.19 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  37.87 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  38.02 
 
 		 657 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  38.27 
 
 		 657 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  37.6 
 
 		 657 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  37.6 
 
 		 657 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  37.56 
 
 		 657 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  35.45 
 
 		 658 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  37.17 
 
 		 658 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  37.12 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  34.45 
 
 		 655 aa  364  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  33.79 
 
 		 655 aa  364  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  33.79 
 
 		 655 aa  364  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  34.41 
 
 		 672 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  31.43 
 
 		 672 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  30.53 
 
 		 675 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  31.71 
 
 		 660 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  31.46 
 
 		 685 aa  263  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  30.03 
 
 		 654 aa  257  4e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  30.09 
 
 		 654 aa  237  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  28.71 
 
 		 653 aa  152  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  28.88 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.21 
 
 		 875 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.71 
 
 		 880 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  28.31 
 
 		 341 aa  87  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  27.58 
 
 		 333 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  28.18 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  27.08 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  26.43 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  28.01 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  25.6 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  23.98 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  26.06 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  23.6 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  27.99 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  26.61 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2122  DHH superfamily protein  23.61 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0688593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.65 
 
 		 888 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  27.99 
 
 		 353 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  23.87 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.21 
 
 		 892 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.57 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  26.3 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  26.62 
 
 		 904 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  28.97 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  24.49 
 
 		 317 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.64 
 
 		 320 aa  77  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  25.07 
 
 		 336 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  24.17 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  25.77 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  26.61 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.27 
 
 		 888 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  24.7 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  27.19 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  23.57 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  24.55 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  26.67 
 
 		 898 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  26.99 
 
 		 336 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  25.93 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  25.65 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  25.88 
 
 		 1077 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  26.23 
 
 		 352 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  24.04 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  24.55 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  26.14 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  27.38 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.16 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  26.16 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  26.16 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  27 
 
 		 333 aa  70.5  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  26.03 
 
 		 902 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  27.61 
 
 		 353 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.44 
 
 		 821 aa  70.5  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  25.77 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.38 
 
 		 854 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  23.29 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  29.5 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.371885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 		 873 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  22.8 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  26.65 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  29.11 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  24.21 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf831  DHH family phosphoesterase  26.67 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  25.36 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  23.56 
 
 		 335 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  23.74 
 
 		 326 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  24.63 
 
 		 396 aa  67  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  26.33 
 
 		 354 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  24.68 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  26.1 
 
 		 859 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>