188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2539 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  100 
 
 		 655 aa  1347    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  48.24 
 
 		 658 aa  641    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  86.41 
 
 		 655 aa  1199    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  86.41 
 
 		 655 aa  1199    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  50.76 
 
 		 658 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  47.67 
 
 		 657 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  47.22 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  47.38 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  47.38 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  47.38 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  47.38 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  47.38 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  47.22 
 
 		 657 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  47.38 
 
 		 657 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  47.22 
 
 		 657 aa  616  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  46.91 
 
 		 657 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  40.71 
 
 		 672 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  40.45 
 
 		 672 aa  491  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  39.43 
 
 		 675 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  38.1 
 
 		 685 aa  428  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  37.33 
 
 		 669 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  35.62 
 
 		 667 aa  416  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  33.94 
 
 		 652 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  35.95 
 
 		 652 aa  360  6e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  32.67 
 
 		 669 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  31.64 
 
 		 654 aa  352  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  30.43 
 
 		 684 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  33.9 
 
 		 660 aa  340  5.9999999999999996e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  31.01 
 
 		 667 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  32.15 
 
 		 654 aa  326  8.000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  29.93 
 
 		 653 aa  234  3e-60  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.73 
 
 		 333 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  25.36 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  26.56 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  25.59 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  25.31 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  27.22 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.76 
 
 		 907 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  22.81 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  25.51 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  23.72 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.78 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  25.5 
 
 		 880 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  23.19 
 
 		 329 aa  66.6  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.08 
 
 		 333 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  25.55 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0637  DHH family protein  23.17 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000263818  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  26.89 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  32.34 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  23.03 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  25.59 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  24.76 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  24.4 
 
 		 333 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.4 
 
 		 892 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 		 873 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  24.44 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.4 
 
 		 903 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  24.76 
 
 		 351 aa  62  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  25.84 
 
 		 314 aa  62  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  23.44 
 
 		 875 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  31.86 
 
 		 513 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  24.76 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  24.76 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.85 
 
 		 873 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  23.44 
 
 		 875 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  23.39 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  22.32 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  22.32 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  27.5 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  24.4 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.34 
 
 		 320 aa  60.1  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  28.46 
 
 		 1077 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  27.74 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  24.44 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  24.44 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  26.61 
 
 		 898 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  24.44 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  24.44 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  23.7 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  32 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  23.53 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  27.81 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  25.84 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  25.53 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  21.04 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  22.63 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  27.13 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.78 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0537  DHH family protein  29.08 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000764384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  22.79 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  22.81 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  23.81 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  25.29 
 
 		 352 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  27.17 
 
 		 344 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0142  DHH phosphoesterase family protein, putative  23.96 
 
 		 316 aa  56.2  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.457819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  23.7 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  21.89 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  24.71 
 
 		 338 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>