155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1977 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  61.61 
 
 		 660 aa  810    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  100 
 
 		 654 aa  1345    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  43.22 
 
 		 654 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  34.05 
 
 		 672 aa  385  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  34.67 
 
 		 672 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  33.93 
 
 		 657 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  34.1 
 
 		 657 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  34.1 
 
 		 657 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  34.1 
 
 		 657 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  34.1 
 
 		 657 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  34.1 
 
 		 657 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  33.7 
 
 		 657 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  35.99 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  33.93 
 
 		 657 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  33.93 
 
 		 657 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  32.61 
 
 		 657 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  31.51 
 
 		 655 aa  353  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  31.51 
 
 		 655 aa  353  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  31.64 
 
 		 655 aa  352  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  31.76 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  32.95 
 
 		 658 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  33.71 
 
 		 685 aa  338  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  31.7 
 
 		 675 aa  325  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.72 
 
 		 669 aa  287  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  28.35 
 
 		 667 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  30.3 
 
 		 667 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  30.43 
 
 		 669 aa  261  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  30.29 
 
 		 652 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  30.29 
 
 		 652 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  29.96 
 
 		 684 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  29 
 
 		 653 aa  187  4e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.93 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.6 
 
 		 821 aa  68.2  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  21.71 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  22.66 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  26.87 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  26.55 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  25.66 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  24.14 
 
 		 339 aa  62  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  26.02 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  25.62 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  23.19 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  27.45 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  24.67 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  22.53 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  26.3 
 
 		 338 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  24.47 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  24.48 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  25.08 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1246  phosphoesterase domain-containing protein  25.65 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  24.35 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  23.33 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  24.24 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  23.01 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  26.89 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0789  DHH family protein  25.64 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  23.34 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  26.48 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  20.92 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  24.49 
 
 		 330 aa  57  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  24.34 
 
 		 336 aa  57  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  22.12 
 
 		 329 aa  57  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  24.38 
 
 		 341 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  22.69 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  26.54 
 
 		 338 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  22.29 
 
 		 326 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  21.43 
 
 		 326 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  25.72 
 
 		 902 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  25.21 
 
 		 333 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  23.16 
 
 		 330 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  21.54 
 
 		 317 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0777  hypothetical protein  29.02 
 
 		 307 aa  54.7  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  26.77 
 
 		 326 aa  54.7  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10110  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  32.14 
 
 		 311 aa  53.9  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000656795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  24.71 
 
 		 330 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0537  DHH family protein  23.59 
 
 		 311 aa  53.9  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000764384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  24.01 
 
 		 880 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  24.68 
 
 		 898 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  23.03 
 
 		 336 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  21.23 
 
 		 317 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  21.71 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1373  phosphoesterase domain-containing protein  26.3 
 
 		 348 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796357  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  22.63 
 
 		 335 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  22.33 
 
 		 333 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  23.73 
 
 		 314 aa  52.8  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2609  Inorganic diphosphatase  25.82 
 
 		 312 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  25.89 
 
 		 904 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  23.03 
 
 		 320 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  22.52 
 
 		 333 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3754  phosphoesterase domain-containing protein  25 
 
 		 333 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0331938  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  25 
 
 		 344 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 		 511 aa  52.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  24.27 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  25.94 
 
 		 547 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  24.09 
 
 		 324 aa  52  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0419  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  32.1 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  23.33 
 
 		 478 aa  51.2  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  25.17 
 
 		 391 aa  50.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  23.22 
 
 		 334 aa  50.8  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.371885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>