173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1967 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  100 
 
 
675 aa  1382    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  46.52 
 
 
672 aa  653    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  44.67 
 
 
672 aa  589  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  42.86 
 
 
685 aa  563  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  39.88 
 
 
658 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  42.11 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  39.01 
 
 
657 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  39.37 
 
 
657 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  39.72 
 
 
657 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  39.16 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  39.16 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  39.16 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  39.72 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  39.22 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  39.16 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  39.16 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  39.16 
 
 
657 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  39.43 
 
 
655 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  39.24 
 
 
655 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  39.24 
 
 
655 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  33.49 
 
 
654 aa  349  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.24 
 
 
669 aa  335  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  31.51 
 
 
667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  32.44 
 
 
660 aa  327  5e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  31.7 
 
 
654 aa  325  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  30.35 
 
 
667 aa  323  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  35.02 
 
 
684 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  29.58 
 
 
669 aa  290  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  30.24 
 
 
652 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  35.67 
 
 
652 aa  276  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  25.48 
 
 
653 aa  167  4e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  25.98 
 
 
325 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  26.22 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  28.12 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  25.07 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30 
 
 
873 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  22.65 
 
 
330 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  28.41 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.27 
 
 
907 aa  68.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  23.36 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  27.21 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  24.78 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  27.17 
 
 
330 aa  66.6  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  26.54 
 
 
389 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  26.67 
 
 
318 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.41 
 
 
769 aa  64.7  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.63 
 
 
333 aa  64.7  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  23.26 
 
 
318 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.45 
 
 
821 aa  63.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  25.5 
 
 
351 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  23.62 
 
 
317 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.99 
 
 
320 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.64 
 
 
892 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 
902 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.44 
 
 
333 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  23.03 
 
 
317 aa  61.6  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  26.23 
 
 
391 aa  60.8  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  28.09 
 
 
354 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  28.31 
 
 
478 aa  60.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  25.36 
 
 
333 aa  60.8  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  23.03 
 
 
326 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  26.59 
 
 
335 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  25.78 
 
 
904 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  24.71 
 
 
335 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  24.04 
 
 
324 aa  59.7  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  25.52 
 
 
336 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  25.77 
 
 
366 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.18 
 
 
335 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  26.45 
 
 
336 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  24.79 
 
 
333 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  26.69 
 
 
498 aa  57.4  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  25.07 
 
 
334 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  24.06 
 
 
330 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  26.94 
 
 
355 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  24.65 
 
 
334 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  23.24 
 
 
339 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 
399 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  25.62 
 
 
1077 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.63 
 
 
905 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  25.87 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  27.75 
 
 
358 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  28.48 
 
 
330 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.31 
 
 
845 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  25.66 
 
 
323 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  25.31 
 
 
872 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  24.14 
 
 
320 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  25.62 
 
 
898 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  22.36 
 
 
313 aa  55.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  22.36 
 
 
313 aa  55.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  26.04 
 
 
474 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  23.03 
 
 
341 aa  54.7  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  27.69 
 
 
888 aa  54.3  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0637  DHH family protein  20.56 
 
 
320 aa  54.3  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000263818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  24.15 
 
 
356 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  27.63 
 
 
352 aa  53.9  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  23.48 
 
 
312 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  25 
 
 
314 aa  53.5  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  26.45 
 
 
335 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  27.33 
 
 
874 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  25.53 
 
 
489 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>