More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1881 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  67.56 
 
 		 488 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  100 
 
 		 498 aa  1003    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  49.47 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  49.16 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  49.26 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  49.36 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  48.74 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  45.86 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  45.86 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  43.78 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  43.78 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  44 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  37.78 
 
 		 486 aa  329  6e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  37.78 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  37.99 
 
 		 486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  41.36 
 
 		 496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  35.78 
 
 		 511 aa  299  9e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  39.35 
 
 		 478 aa  297  4e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  38.43 
 
 		 516 aa  296  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  39.12 
 
 		 547 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  37.86 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  43.84 
 
 		 374 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  46.5 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  44.86 
 
 		 334 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  43.93 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  36.42 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  35.62 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  35 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  35.33 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  33.61 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  38.08 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  32.96 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  33.15 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  33.92 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  32.38 
 
 		 374 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  32.38 
 
 		 374 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  32.02 
 
 		 368 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  33.13 
 
 		 351 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.3 
 
 		 429 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  34.17 
 
 		 341 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  35.48 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  34.33 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  29.73 
 
 		 375 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  34.77 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  32.12 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  34.16 
 
 		 355 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  34.53 
 
 		 346 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.37 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  31.77 
 
 		 324 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  32.57 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  31.34 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  34.17 
 
 		 420 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.65 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  29.43 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  29.61 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  29.73 
 
 		 327 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.14 
 
 		 888 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.62 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  25.59 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  24.92 
 
 		 875 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  24.15 
 
 		 898 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  30.74 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.69 
 
 		 845 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  27.74 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  28.15 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.92 
 
 		 892 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0332  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.09 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.0219127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.46 
 
 		 903 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  27.74 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  27.74 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  27.74 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  27.74 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  27.74 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  30.72 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1292  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  32.39 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  25.83 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  27.52 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  26.85 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  30.06 
 
 		 880 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.33 
 
 		 875 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  25.74 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  27.44 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  31.48 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  27.93 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.83 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.32 
 
 		 905 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.83 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0143  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  31.4 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000077793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30.77 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  26.51 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  25.79 
 
 		 907 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  26.69 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  27.13 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>