73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2314 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  729    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  67.07 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  65.68 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  62.72 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  65.09 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  52.01 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  36.89 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  36.89 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  36.89 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  36.66 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  35.53 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  33.44 
 
 		 498 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  32.18 
 
 		 478 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  32.2 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  31 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  31.44 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  34.97 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  35.12 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  34.27 
 
 		 513 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  34.01 
 
 		 516 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  34.25 
 
 		 474 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  30.43 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  32.07 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  30.58 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  29.66 
 
 		 547 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  32.07 
 
 		 489 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  31.8 
 
 		 486 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  31.7 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  31.33 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  29.86 
 
 		 496 aa  135  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 487 aa  135  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  30.31 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  31.41 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  30.13 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  31.37 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  29.31 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  28.15 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  30.18 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 487 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  26.38 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  26.25 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  26.73 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  28.32 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  25.17 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  27.37 
 
 		 482 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  26.79 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  23.53 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  25.37 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.84 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  26.37 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.05 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  25.96 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  27.37 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  26.4 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  25.76 
 
 		 880 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  29.07 
 
 		 880 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  23.19 
 
 		 875 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  25.13 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  22.9 
 
 		 875 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1362  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  26.97 
 
 		 301 aa  46.2  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00890264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  25 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.65 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  23.32 
 
 		 892 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.43 
 
 		 877 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  24.76 
 
 		 873 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3754  phosphoesterase domain-containing protein  23.35 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0331938  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  22.29 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  27.85 
 
 		 874 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  22.41 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>