91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1931 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  96.53 
 
 		 346 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 346 aa  704    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  65.68 
 
 		 355 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  64.56 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  63.86 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  52.75 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  40 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  40 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  40 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  39.29 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  35.84 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  35.37 
 
 		 547 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  35.54 
 
 		 478 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  35.09 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  35.35 
 
 		 474 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  35.33 
 
 		 500 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  34.15 
 
 		 516 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  32.42 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  35.65 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 		 511 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  30.56 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  30.47 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  32.41 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  32.6 
 
 		 497 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  31.89 
 
 		 489 aa  149  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  30.03 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  32.79 
 
 		 496 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  33.45 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 486 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 		 486 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  33.68 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  32.05 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  27.71 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  33.57 
 
 		 487 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  30.15 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  32.59 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  31.63 
 
 		 487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  29.38 
 
 		 487 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  30.24 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  31.21 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  28.86 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  27.8 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  29.55 
 
 		 420 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  27.81 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  26.58 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  25.68 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  27.72 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  27.6 
 
 		 408 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.95 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  26.95 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  30.53 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  27.68 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  28.37 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  24.92 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 873 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  23.53 
 
 		 875 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  24.18 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1975  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.81 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.683174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2009  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.81 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  24.84 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3754  phosphoesterase domain-containing protein  26.74 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0331938  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1362  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  25.83 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00890264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  25.16 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.74 
 
 		 877 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1455  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.67 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.518126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  25.64 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  22.88 
 
 		 875 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  22.42 
 
 		 892 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  27.63 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  21.86 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  25.16 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  28 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  24.1 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  24.46 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  22.81 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  26.09 
 
 		 880 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  26.47 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003822  manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.25 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000209246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01860  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.25 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0206  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.9 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.773768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  24.1 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  21.47 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0785  inorganic diphosphatase  27.45 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  26.42 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  20.64 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  20.64 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  22.73 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>