61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2480 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  82.39 
 
 		 420 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  72.16 
 
 		 346 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  61.25 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  57.62 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  49.41 
 
 		 347 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  43.57 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  41.91 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 500 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  31.65 
 
 		 498 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 		 474 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  31.42 
 
 		 374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  31.91 
 
 		 488 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 		 486 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  31.18 
 
 		 547 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.94 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  31.91 
 
 		 478 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  30.24 
 
 		 486 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  29.87 
 
 		 487 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  29.14 
 
 		 511 aa  123  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 		 486 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  32.48 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  32.27 
 
 		 496 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  31.9 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  30.36 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  30.9 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  29.49 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  30.74 
 
 		 489 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  28.92 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  28.92 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  28.67 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  28.92 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.24 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  30.61 
 
 		 516 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  30.27 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  30.95 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  29.25 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  30 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  29.97 
 
 		 484 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  25.99 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  28.62 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  25.45 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  27.18 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  25.63 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.67 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  26.67 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  26.53 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  26.01 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.87 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  24.54 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  24.44 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  22.59 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  23.05 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  25.6 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  26.94 
 
 		 326 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  24.74 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  28.7 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>