101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0370 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  45.11 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  42.26 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  44.26 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  41.25 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  42.5 
 
 		 341 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  43.25 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  41.55 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  34 
 
 		 511 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  32.7 
 
 		 478 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  33.11 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  31.61 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 		 374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.83 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  33.11 
 
 		 489 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  31.39 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  33.67 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 		 486 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  31.95 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 		 487 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  30.33 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  29.93 
 
 		 516 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.7 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.73 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  30 
 
 		 513 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  29.97 
 
 		 487 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  30.84 
 
 		 496 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  29.75 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  31.83 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  30.19 
 
 		 497 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  32.18 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  29.3 
 
 		 500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  26.71 
 
 		 483 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  28.38 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  26.95 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  28.17 
 
 		 487 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  29.88 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  25.76 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  28.41 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  26.4 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  29.33 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  27.52 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  28.39 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  26.39 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  27.36 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  28.1 
 
 		 393 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  26.61 
 
 		 420 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  25.93 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  25.91 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  25.62 
 
 		 420 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  26.52 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  25.81 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.8 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  27.24 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  31.63 
 
 		 880 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  26.69 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.33 
 
 		 903 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  30.68 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0206  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.06 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.773768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  28.57 
 
 		 880 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3754  phosphoesterase domain-containing protein  26.44 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0331938  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2154  phosphoesterase RecJ domain protein  28.5 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  26.02 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  34.15 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  28.99 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  28.21 
 
 		 875 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.48 
 
 		 875 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.98 
 
 		 877 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  27.71 
 
 		 888 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.5 
 
 		 892 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  27.36 
 
 		 386 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  28.65 
 
 		 326 aa  49.3  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.76 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.29 
 
 		 903 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.29 
 
 		 903 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  28 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  28.38 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  27.14 
 
 		 880 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  27.98 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 890 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.82 
 
 		 907 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 		 875 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  23.63 
 
 		 896 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.63 
 
 		 847 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  24.21 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  28.57 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  27.91 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  29.87 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  30.25 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  28.12 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  28.03 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  29.05 
 
 		 874 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  29.41 
 
 		 872 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  32.28 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  30.64 
 
 		 366 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.6 
 
 		 854 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.47 
 
 		 888 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>