More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0367 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  986    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  67.77 
 
 		 498 aa  667    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  48.2 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  46.58 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  47.15 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  47.03 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  45.17 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  44.44 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  43.62 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  42.8 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  42.28 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  42.92 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  40.68 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  39.32 
 
 		 516 aa  317  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  38.76 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  39.29 
 
 		 547 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  37.9 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  37.43 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  37.19 
 
 		 487 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  39.37 
 
 		 513 aa  305  9.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  43.31 
 
 		 374 aa  292  9e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  37.53 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  44.01 
 
 		 339 aa  270  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  40.84 
 
 		 334 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  40.13 
 
 		 423 aa  227  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  36.91 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  36.96 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  35 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  33.44 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  32.83 
 
 		 374 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  32.83 
 
 		 374 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  32.83 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  35.46 
 
 		 391 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  32.34 
 
 		 375 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  35.84 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  35.84 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  32.69 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  32.41 
 
 		 420 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  33.6 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  35.53 
 
 		 355 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  33.13 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  32.21 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  34.78 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.6 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.59 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  34.57 
 
 		 360 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  32.84 
 
 		 349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  34.33 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  29.78 
 
 		 429 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  31.75 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  32.88 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  32.26 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  33.11 
 
 		 335 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  31.65 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  34.11 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  29.97 
 
 		 347 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.88 
 
 		 327 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  28.61 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  27.94 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.31 
 
 		 672 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  26.04 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  26.04 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.46 
 
 		 888 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  29.74 
 
 		 880 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  23.46 
 
 		 898 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  33.01 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  33.01 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.76 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  32.68 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  32.84 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  33.01 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.39 
 
 		 892 aa  64.3  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  25.53 
 
 		 667 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 		 896 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  24.49 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  23.3 
 
 		 875 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  24.09 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  22.98 
 
 		 875 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.37 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.84 
 
 		 905 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  28.45 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  33.67 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  28.48 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  28.48 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  24.92 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  27.8 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  26.17 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  26.89 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  28.7 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.43 
 
 		 903 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>