64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0342 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 347 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  51.33 
 
 		 420 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  49.41 
 
 		 335 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  49.84 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  49.08 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  47.8 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  41.58 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  37.46 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  35.69 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  32.21 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  31.09 
 
 		 483 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  33 
 
 		 513 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  30.13 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  30.82 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  30.74 
 
 		 547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  29.77 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  29.37 
 
 		 487 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  32.19 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  29.61 
 
 		 498 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  27.62 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  31.56 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  28.72 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  28.53 
 
 		 485 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  27.92 
 
 		 486 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 		 486 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  30.65 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  28.11 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  29.35 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  29.17 
 
 		 484 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  27.11 
 
 		 487 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  30.31 
 
 		 496 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 		 482 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  29.88 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  27.36 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  29.88 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  29.88 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  28.97 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  28.11 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  28.21 
 
 		 420 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  26.9 
 
 		 497 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  25.7 
 
 		 355 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  28.2 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  26.33 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  27.04 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  26.28 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  27.27 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  25.44 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  26.32 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  25.7 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  25.84 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  25 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.97 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  24.81 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  25.84 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.1 
 
 		 892 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.42 
 
 		 903 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  31.93 
 
 		 880 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  24.63 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01960  exopolyphosphatase, putative  26.94 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.136857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.76 
 
 		 658 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  25.83 
 
 		 888 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>