63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3124 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 341 aa  702    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  67.65 
 
 		 365 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  61.25 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  57.76 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  60.31 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  46.71 
 
 		 347 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  42.5 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  40.94 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  34.17 
 
 		 498 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  35.35 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  34.04 
 
 		 488 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  32.99 
 
 		 478 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  33.92 
 
 		 486 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33.92 
 
 		 486 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  31.69 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  34.38 
 
 		 516 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  32.76 
 
 		 511 aa  139  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  32.8 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  33.1 
 
 		 513 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  30.19 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  32.98 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  30.46 
 
 		 483 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  30.94 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  31.23 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  30.33 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  28.96 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  28.96 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  28.96 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  29.39 
 
 		 485 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  31.21 
 
 		 547 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  31.66 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  30.74 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  33.33 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  32.96 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  30.82 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  28.28 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.3 
 
 		 366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  30.69 
 
 		 484 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  30.57 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  30.07 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  29.37 
 
 		 482 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  27.71 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  28.25 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  24.69 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  26.6 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  25 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  28.27 
 
 		 420 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  27.59 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  27.27 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  28.38 
 
 		 427 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  27.38 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  27.21 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  21.69 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  23.76 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  25.33 
 
 		 880 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  28.74 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  26.79 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0206  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.56 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.773768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  25.37 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  24.8 
 
 		 880 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>