160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1773 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  71.49 
 
 		 483 aa  677    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  69.61 
 
 		 482 aa  644    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  71.05 
 
 		 485 aa  666    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 487 aa  966    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  69.18 
 
 		 484 aa  633  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  48.74 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  44.44 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  42.53 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  40.57 
 
 		 487 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  40.43 
 
 		 474 aa  353  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  40.04 
 
 		 489 aa  349  8e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  39.21 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  40.34 
 
 		 496 aa  306  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  37.92 
 
 		 513 aa  292  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33.74 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  33.54 
 
 		 486 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  36.36 
 
 		 516 aa  276  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  38.89 
 
 		 547 aa  275  9e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  38.81 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  33.2 
 
 		 511 aa  252  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  39.17 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  44.77 
 
 		 339 aa  229  9e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  39.56 
 
 		 334 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  38.24 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  31.59 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  32.04 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  32.6 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  29.95 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  30.74 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  32.02 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  30.56 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  30.56 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  30.56 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  29.27 
 
 		 420 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  29 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.79 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  28.85 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  30.17 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  31.85 
 
 		 349 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  33.09 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  28.17 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.55 
 
 		 427 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  29.17 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  28.28 
 
 		 341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 		 346 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  29.6 
 
 		 365 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  29.52 
 
 		 429 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  28.21 
 
 		 346 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  30.34 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  29.21 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  29.03 
 
 		 335 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  29.3 
 
 		 347 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  29.55 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  26.13 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  25.85 
 
 		 335 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  25 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  34.43 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  33.58 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  34.33 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  26.16 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  30.23 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  30.51 
 
 		 880 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  29.55 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  31.03 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  29.57 
 
 		 641 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  29.55 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  32.79 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  29.13 
 
 		 233 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  29.17 
 
 		 227 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  31.4 
 
 		 223 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  37.35 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  37.35 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  37.35 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  37.35 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 217 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  31.45 
 
 		 226 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  25.81 
 
 		 217 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  33.04 
 
 		 219 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  29.75 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  30.06 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  36.14 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  36.14 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  26.81 
 
 		 672 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  30.83 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  36.14 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  29.51 
 
 		 234 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  29.51 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  29.51 
 
 		 234 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 		 330 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 896 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  31.3 
 
 		 223 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  27.97 
 
 		 221 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 558 aa  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  36.14 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>