167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0146 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  68.15 
 
 
500 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
474 aa  964    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  62.5 
 
 
489 aa  630  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  58.14 
 
 
497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  55.22 
 
 
487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  45.86 
 
 
498 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  43.62 
 
 
488 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  41.05 
 
 
485 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  42.04 
 
 
483 aa  362  6e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  40.43 
 
 
487 aa  353  5e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  41.28 
 
 
484 aa  343  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  40.25 
 
 
482 aa  339  5e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  38.3 
 
 
496 aa  302  9e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  37.74 
 
 
516 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  38.51 
 
 
513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  45.57 
 
 
339 aa  273  6e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  41.03 
 
 
374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
486 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
486 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  35.94 
 
 
547 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  36.21 
 
 
478 aa  249  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  32.79 
 
 
487 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  39.88 
 
 
334 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  29.98 
 
 
511 aa  223  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  40.56 
 
 
423 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  33.14 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  34.67 
 
 
393 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  32.92 
 
 
399 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 
391 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  31.74 
 
 
396 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  33.45 
 
 
427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  34.11 
 
 
349 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  29.32 
 
 
374 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  29.32 
 
 
368 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  32.74 
 
 
420 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  29.32 
 
 
374 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  32.45 
 
 
420 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  36.11 
 
 
346 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  35.16 
 
 
346 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  35.09 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  30.15 
 
 
375 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  32.91 
 
 
408 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  32.3 
 
 
429 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  32.52 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  32.12 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  31.69 
 
 
341 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  33.94 
 
 
355 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  31.63 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  34.74 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  31.18 
 
 
365 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  33.22 
 
 
335 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  31.99 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  29.55 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  31.5 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  30.13 
 
 
347 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  29.7 
 
 
335 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.14 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  24.71 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  26.54 
 
 
896 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  24.93 
 
 
657 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  24.93 
 
 
657 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  24.93 
 
 
657 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  24.93 
 
 
657 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  24.93 
 
 
657 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  24.44 
 
 
888 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  24.93 
 
 
657 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.27 
 
 
657 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  24.87 
 
 
672 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  24.93 
 
 
657 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  25.41 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  25.41 
 
 
657 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.06 
 
 
892 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  22.62 
 
 
669 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  27.96 
 
 
880 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  22.43 
 
 
660 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  24.77 
 
 
652 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  24.77 
 
 
652 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  26.79 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  26.04 
 
 
675 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  25.15 
 
 
654 aa  54.7  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2609  Inorganic diphosphatase  25.98 
 
 
312 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  26.25 
 
 
875 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  24.86 
 
 
657 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.12 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  26.25 
 
 
875 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  24 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  25.51 
 
 
685 aa  51.2  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  23.77 
 
 
658 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.12 
 
 
309 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.12 
 
 
309 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  29.75 
 
 
575 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  27.49 
 
 
366 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  27.63 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  26.42 
 
 
325 aa  50.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  27.15 
 
 
339 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2635  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.5 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2585  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.5 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000705472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.5 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>