71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4087 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  848    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  75.51 
 
 
420 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  75.26 
 
 
420 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  66.99 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  66.01 
 
 
429 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  65.29 
 
 
427 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  43.82 
 
 
393 aa  315  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  32.96 
 
 
498 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  32.05 
 
 
511 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  29.9 
 
 
485 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  32.21 
 
 
488 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 
486 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  34.57 
 
 
516 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  32.75 
 
 
339 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 
500 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  32.91 
 
 
474 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  31.23 
 
 
486 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 
486 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 
487 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  29.68 
 
 
483 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  31.96 
 
 
513 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  33.04 
 
 
547 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  31.89 
 
 
478 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  30.68 
 
 
484 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  34.58 
 
 
487 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
489 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  32.41 
 
 
497 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 
482 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 
487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  30.75 
 
 
374 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  31.94 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  30.17 
 
 
423 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  29.91 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  30.58 
 
 
396 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  27.43 
 
 
393 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  29.75 
 
 
391 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 
399 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  30.29 
 
 
389 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  26.78 
 
 
346 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  27.38 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  25 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  27.08 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  27.46 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  26.77 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  26.52 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  26.14 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  23.57 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  25.7 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  24.17 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  24.17 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  24.34 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  24.92 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  23.89 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  25 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  27.02 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  24.54 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  27.23 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  31.52 
 
 
657 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  31.52 
 
 
657 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  31.52 
 
 
657 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  31.36 
 
 
657 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  31.1 
 
 
657 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  30.49 
 
 
657 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  30.49 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  30.49 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  30.49 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  30.49 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  30.49 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  26.67 
 
 
872 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  26.39 
 
 
874 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>