71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1927 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
334 aa  666    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  72.89 
 
 
423 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  49.85 
 
 
374 aa  315  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  48.35 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  44.86 
 
 
498 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  42.56 
 
 
516 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  43.33 
 
 
496 aa  235  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  42.38 
 
 
547 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  42.59 
 
 
513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  41.25 
 
 
485 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  41.32 
 
 
478 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  41.02 
 
 
483 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  39.94 
 
 
500 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  39.88 
 
 
474 aa  225  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  40.84 
 
 
488 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  39.75 
 
 
489 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  39.56 
 
 
487 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  41.1 
 
 
484 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  36.28 
 
 
497 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  39.51 
 
 
482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  34.17 
 
 
486 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  39.63 
 
 
487 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  33.54 
 
 
486 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  34.6 
 
 
511 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33.86 
 
 
486 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  34.17 
 
 
487 aa  187  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  37 
 
 
393 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  37.58 
 
 
399 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  33.86 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  34.84 
 
 
396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  34.95 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  33.93 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  34.04 
 
 
349 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  31.45 
 
 
355 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  32.33 
 
 
360 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  28.26 
 
 
368 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  27.95 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  27.95 
 
 
374 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.56 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.34 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  27.81 
 
 
375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  30.82 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  30.9 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  29.91 
 
 
408 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  31.89 
 
 
420 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  29.89 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  29.63 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  29.77 
 
 
347 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  30.43 
 
 
346 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  29.34 
 
 
420 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  29 
 
 
365 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  29.87 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  27.85 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  30.45 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  26.98 
 
 
324 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  26.85 
 
 
335 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  28.73 
 
 
420 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.22 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  25.58 
 
 
652 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  25.58 
 
 
652 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  22.94 
 
 
667 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1002  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.11 
 
 
311 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285783  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  25.58 
 
 
667 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  23.26 
 
 
669 aa  46.2  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  24.2 
 
 
888 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  23.43 
 
 
863 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.76 
 
 
669 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  23.89 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  28.02 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  26.75 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.69 
 
 
903 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>