174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0397 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  69.61 
 
 
482 aa  650    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  100 
 
 
485 aa  961    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  71.34 
 
 
484 aa  659    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  71.05 
 
 
487 aa  666    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  79.75 
 
 
483 aa  756    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  49.16 
 
 
498 aa  435  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  46.58 
 
 
488 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  43.57 
 
 
500 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  41.05 
 
 
474 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  39.26 
 
 
489 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  41.93 
 
 
497 aa  361  2e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  40.04 
 
 
487 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  40.17 
 
 
478 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  38.69 
 
 
496 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  39.45 
 
 
513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33.68 
 
 
486 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  33.68 
 
 
486 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  33.06 
 
 
486 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  38.77 
 
 
516 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.4 
 
 
487 aa  272  9e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  31.84 
 
 
511 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  38.43 
 
 
547 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  41.47 
 
 
374 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  44.97 
 
 
339 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  41.25 
 
 
334 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  39.64 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  36.4 
 
 
391 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  34.59 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  34.32 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  35.67 
 
 
393 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  34.29 
 
 
399 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  30.81 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  33.53 
 
 
368 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  33.53 
 
 
374 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  33.53 
 
 
374 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  29.9 
 
 
408 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  30.62 
 
 
420 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  30.35 
 
 
420 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  34.46 
 
 
375 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.33 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  29.33 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  31.69 
 
 
351 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  28.71 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  27.27 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  29.39 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  30.46 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  31.73 
 
 
346 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  28.84 
 
 
346 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.94 
 
 
346 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.94 
 
 
349 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  28.85 
 
 
335 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  28.52 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  29.17 
 
 
420 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  28.53 
 
 
347 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  25.76 
 
 
335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  27.55 
 
 
355 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  27.31 
 
 
360 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.87 
 
 
327 aa  84  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.73 
 
 
672 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.09 
 
 
888 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  30.71 
 
 
227 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
217 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
626 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  34.29 
 
 
352 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  32.17 
 
 
219 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  32.5 
 
 
215 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  31.71 
 
 
220 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  29.71 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 
215 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 
224 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  27.97 
 
 
216 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
233 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  27.97 
 
 
216 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  27.97 
 
 
216 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  32.17 
 
 
334 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  32.17 
 
 
334 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.2 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.17 
 
 
330 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.05 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  28.81 
 
 
217 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  26.56 
 
 
880 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.41 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  31.71 
 
 
234 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.2 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  26.5 
 
 
219 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.15 
 
 
220 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2837  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.22 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  26.5 
 
 
220 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2456  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.22 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  26.5 
 
 
220 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  31.78 
 
 
563 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1715  phosphoesterase domain-containing protein  24.03 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 
346 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  31.78 
 
 
562 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  31.78 
 
 
563 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.22 
 
 
309 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.53 
 
 
309 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 
234 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.22 
 
 
309 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>