188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0754 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1018    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  59.79 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  58.69 
 
 		 489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  58.14 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  52.41 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  43.78 
 
 		 498 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  42.8 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  41.93 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  41.98 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  39.21 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  40.72 
 
 		 484 aa  332  8e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  40.29 
 
 		 482 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  37.31 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  37.74 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  36.48 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  36.07 
 
 		 547 aa  264  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  37.95 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33.2 
 
 		 486 aa  263  8e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 486 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.06 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  38.19 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  40.43 
 
 		 339 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  31.3 
 
 		 511 aa  236  9e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  36.28 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  35.99 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  34.6 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  34.69 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  34.08 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  33.02 
 
 		 396 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  34.23 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  33.06 
 
 		 420 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  27.63 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  34.59 
 
 		 429 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  33.54 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  32.41 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  27.95 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  27.95 
 
 		 374 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  33.79 
 
 		 427 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  31.71 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  27.95 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.6 
 
 		 346 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  32.25 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.48 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  29.77 
 
 		 324 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.43 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  27.73 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  30.77 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  28.87 
 
 		 365 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  30.07 
 
 		 341 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  30.43 
 
 		 360 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  27.4 
 
 		 346 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  28.94 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  27.18 
 
 		 335 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  26.9 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  27.84 
 
 		 335 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.17 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  25.94 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  25.94 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  25.94 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  25.94 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  25.94 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  27.06 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.59 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  25.94 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  27.06 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  25.94 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  26.71 
 
 		 872 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  27.52 
 
 		 874 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.3 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.98 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.78 
 
 		 672 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.8 
 
 		 658 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  24.76 
 
 		 655 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  24.36 
 
 		 217 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.21 
 
 		 845 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  24.26 
 
 		 327 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  27.87 
 
 		 595 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  29.13 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 		 566 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 566 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  26.21 
 
 		 655 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  26.21 
 
 		 655 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 		 225 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  23.13 
 
 		 216 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  27.56 
 
 		 563 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  24.4 
 
 		 653 aa  50.4  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  24.37 
 
 		 641 aa  50.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.57 
 
 		 605 aa  50.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  28.39 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  26.19 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  24.83 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  27.1 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  23.02 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  23.98 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  25.64 
 
 		 652 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 620 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>