180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1641 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  70.06 
 
 
483 aa  676    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  68.87 
 
 
487 aa  664    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  71.37 
 
 
485 aa  689    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  91.53 
 
 
482 aa  858    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
484 aa  968    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  49.16 
 
 
498 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  48.1 
 
 
488 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 
500 aa  385  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  41.75 
 
 
474 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  41.16 
 
 
497 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  40.13 
 
 
489 aa  349  6e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  39.79 
 
 
487 aa  335  9e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  37.95 
 
 
496 aa  298  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  37.73 
 
 
513 aa  291  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  37.26 
 
 
516 aa  290  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  38.06 
 
 
478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  37.47 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 
486 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 
486 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  33.6 
 
 
486 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.47 
 
 
487 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  43.66 
 
 
374 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  45.86 
 
 
339 aa  243  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  30.12 
 
 
511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  41.28 
 
 
334 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  38.39 
 
 
423 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  34.75 
 
 
399 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  31.73 
 
 
420 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  33.43 
 
 
396 aa  170  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  32.65 
 
 
389 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  34.12 
 
 
393 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.13 
 
 
420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  30.87 
 
 
420 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  30.68 
 
 
408 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  32.64 
 
 
391 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.99 
 
 
427 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  31.1 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  31.1 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  31.1 
 
 
368 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.37 
 
 
429 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.29 
 
 
375 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  32.01 
 
 
351 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  31.64 
 
 
365 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  31.27 
 
 
346 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  32.59 
 
 
346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  30.69 
 
 
341 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  31.09 
 
 
393 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  28.83 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  33.96 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  29.17 
 
 
347 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.99 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  31.82 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  29.97 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  28.95 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  28.95 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  28.68 
 
 
360 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  25.68 
 
 
335 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.14 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  26.48 
 
 
672 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  32.51 
 
 
888 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  31.43 
 
 
658 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.06 
 
 
334 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.06 
 
 
334 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.06 
 
 
330 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30.34 
 
 
309 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  28.78 
 
 
227 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.06 
 
 
330 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.26 
 
 
330 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  29.23 
 
 
216 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 
330 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  29.23 
 
 
216 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  29.23 
 
 
216 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2635  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2585  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000705472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 
220 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2832  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0785  inorganic diphosphatase  29.61 
 
 
311 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  30.53 
 
 
217 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2837  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2456  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2626  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.78 
 
 
309 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0570344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1924  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.21 
 
 
310 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00852354  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  33.86 
 
 
234 aa  53.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  33.07 
 
 
234 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  33.04 
 
 
219 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  30.25 
 
 
220 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.45 
 
 
337 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 
215 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  28.1 
 
 
213 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  28.26 
 
 
563 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  32.56 
 
 
234 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  31.62 
 
 
217 aa  51.2  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 
217 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  30.39 
 
 
224 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  28.46 
 
 
233 aa  50.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
606 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>