76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1877 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  100 
 
 		 360 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  70.39 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  67.07 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  64.56 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  64.56 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  52.15 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  41.89 
 
 		 374 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  41.89 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  41.89 
 
 		 374 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  41.06 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  34.57 
 
 		 488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  32.66 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  32 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  32.2 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  30.65 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  31.51 
 
 		 498 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  32.53 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  29.17 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  31.6 
 
 		 516 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 		 511 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  29.18 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  30.6 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 		 500 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  29.97 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  31.97 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  30.34 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  32.8 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  33.23 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  30.26 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  31.41 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.72 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  29.09 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  31.27 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  31.1 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  28 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  28.17 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  30.23 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  28.34 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  28.38 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  29.29 
 
 		 487 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  26.33 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 		 393 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  25.87 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  28.33 
 
 		 484 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  28.03 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  28.62 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  27.08 
 
 		 408 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.94 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  25.65 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  25.32 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  28.29 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  24.71 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  25.88 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 865 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  23.74 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1362  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  25.83 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00890264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  23.23 
 
 		 880 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  24.92 
 
 		 880 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  22.25 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.47 
 
 		 877 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  22.19 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  23.68 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  24.73 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  23.4 
 
 		 667 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  26.42 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  24.14 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  27.67 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  27.07 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  22.04 
 
 		 892 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  24.31 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  26.75 
 
 		 875 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>