More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0616 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  100 
 
 		 487 aa  997    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  57.72 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  55.88 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  55.22 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  52.41 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  44 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  40.57 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  40.04 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  41.47 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  42.92 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  39.37 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  39.11 
 
 		 482 aa  325  8.000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  38.43 
 
 		 516 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  37.39 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  36.97 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  37.26 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  37.15 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  43.15 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  42.9 
 
 		 374 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  33.06 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  32.41 
 
 		 486 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.14 
 
 		 487 aa  239  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 		 511 aa  230  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  40.36 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  39.63 
 
 		 334 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  35.91 
 
 		 389 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  35.25 
 
 		 393 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  34.52 
 
 		 399 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  34.36 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  34.58 
 
 		 408 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  32.89 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  34.51 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  30.19 
 
 		 374 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  30.19 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  30.45 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  29.27 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  32.56 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  33.9 
 
 		 429 aa  150  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  32.01 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  29.93 
 
 		 420 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  32.52 
 
 		 420 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  34.06 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  32.25 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  29.49 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  30.87 
 
 		 351 aa  143  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  32.86 
 
 		 346 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.63 
 
 		 349 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.43 
 
 		 335 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  32.74 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  30.18 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  31.63 
 
 		 346 aa  126  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  31.52 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.39 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  30.89 
 
 		 360 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  29.84 
 
 		 335 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  28.83 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  29.45 
 
 		 327 aa  87.4  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  35.09 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  34.21 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.97 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.21 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  25.76 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  25.79 
 
 		 888 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  25.76 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  25.76 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  25.76 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  25.76 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  25.76 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  25.76 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  24.86 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  25.76 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.78 
 
 		 672 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  25 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.16 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.83 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  22.89 
 
 		 669 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.36 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  30.97 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  28.21 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2548  potassium efflux system protein  30.7 
 
 		 662 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1057  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0579  potassium efflux system protein  31.25 
 
 		 625 aa  60.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0224843  hitchhiker  0.000000778205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  24.38 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  24.24 
 
 		 652 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 679 aa  60.1  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.46 
 
 		 638 aa  60.1  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.93 
 
 		 892 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2247  potassium efflux system protein  31.58 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.3 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  25.81 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.84 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  32.59 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  30.83 
 
 		 220 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1441  potassium efflux system protein  30.43 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  28.79 
 
 		 220 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  30.77 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 347 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>