More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1392 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2548  potassium efflux system protein  62.93 
 
 		 662 aa  770    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  100 
 
 		 641 aa  1261    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02528  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  57.14 
 
 		 632 aa  689    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  63.86 
 
 		 642 aa  816    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1347  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  61.09 
 
 		 640 aa  790    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0230885  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  63.27 
 
 		 652 aa  815    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1441  potassium efflux system protein  61.93 
 
 		 644 aa  786    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  64.12 
 
 		 652 aa  805    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  63.74 
 
 		 638 aa  797    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3047  potassium efflux system protein  59.43 
 
 		 623 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.864029  normal  0.194006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2247  potassium efflux system protein  59.28 
 
 		 641 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1486  sodium/hydrogen exchanger  48.87 
 
 		 622 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.09304  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  48.8 
 
 		 679 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3348  sodium/hydrogen exchanger  53.5 
 
 		 626 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0579  potassium efflux system protein  52.96 
 
 		 625 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0224843  hitchhiker  0.000000778205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  48.12 
 
 		 624 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1862  potassium efflux system protein  51.47 
 
 		 623 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.508277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  48.3 
 
 		 624 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  48.63 
 
 		 642 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  48.63 
 
 		 642 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1057  sodium/hydrogen exchanger  49.6 
 
 		 622 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0789  potassium efflux system protein  49.84 
 
 		 670 aa  525  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00221734  normal  0.126459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0086  potassium efflux system protein  45.18 
 
 		 633 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  48.59 
 
 		 610 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  51.73 
 
 		 638 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  45.3 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  44.54 
 
 		 601 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0368  potassium efflux system protein  49.01 
 
 		 608 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0111  potassium efflux system protein  46.07 
 
 		 636 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000503548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2060  potassium efflux system protein  46.63 
 
 		 619 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0034449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  44.74 
 
 		 631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.42 
 
 		 600 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2764  potassium efflux system protein  46.66 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.87 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  43.87 
 
 		 620 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2759  potassium efflux system protein  45.76 
 
 		 627 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.87 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.87 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.87 
 
 		 620 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.71 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.87 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  43.87 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.71 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.53 
 
 		 620 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.37 
 
 		 620 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.53 
 
 		 620 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.43 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.37 
 
 		 620 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.12 
 
 		 617 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.19 
 
 		 598 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.21 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10218  potassium efflux system protein  41.83 
 
 		 629 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.65 
 
 		 602 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.65 
 
 		 602 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.65 
 
 		 602 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  42.1 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.04 
 
 		 602 aa  422  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  40.26 
 
 		 628 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.92 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  40.13 
 
 		 628 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  44.35 
 
 		 598 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.34 
 
 		 604 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.41 
 
 		 635 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.24 
 
 		 602 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.24 
 
 		 601 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.24 
 
 		 601 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.81 
 
 		 596 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.24 
 
 		 601 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  41.38 
 
 		 601 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  41.48 
 
 		 616 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.07 
 
 		 601 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.84 
 
 		 601 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.75 
 
 		 604 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.38 
 
 		 601 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.07 
 
 		 601 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.38 
 
 		 601 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.38 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.4 
 
 		 607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.38 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  41.38 
 
 		 601 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.38 
 
 		 601 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.37 
 
 		 627 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.06 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.51 
 
 		 605 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.29 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.69 
 
 		 646 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.11 
 
 		 632 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.63 
 
 		 608 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  44.77 
 
 		 602 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  44.71 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.25 
 
 		 602 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  46.79 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.33 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.9 
 
 		 601 aa  381  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  44.77 
 
 		 595 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.55 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  44.25 
 
 		 595 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.2 
 
 		 623 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  44.43 
 
 		 595 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.39 
 
 		 613 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>