78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0027 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  100 
 
 		 327 aa  668    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  35.46 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  31.74 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  30.34 
 
 		 516 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  32.33 
 
 		 478 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  29.64 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  30.5 
 
 		 513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  27.92 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  29.23 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  31.82 
 
 		 496 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  29.7 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  28.43 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  28.48 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  28.67 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  28.67 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  28.67 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  27.51 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  29.52 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  26.94 
 
 		 374 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  29.18 
 
 		 489 aa  99  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  27.88 
 
 		 488 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  26.69 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  27.67 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 		 511 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  28.17 
 
 		 474 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 486 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  26.78 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  26.73 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  28.98 
 
 		 487 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 486 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 		 486 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  33.68 
 
 		 487 aa  92.8  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  26.96 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.53 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 		 485 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  25.87 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  28.52 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  25.24 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 500 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  26.84 
 
 		 355 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  27 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  26.59 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  28.16 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  25.62 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  25.18 
 
 		 487 aa  79.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  26.35 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  23.76 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  25.63 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  26.54 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  26.6 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  26.67 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  27.78 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  27.78 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  26.28 
 
 		 427 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  25.26 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  26.32 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.61 
 
 		 854 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  24.61 
 
 		 654 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  23.1 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  23.84 
 
 		 904 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  22.78 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  26.02 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  24.71 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  24.68 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0462  DHH family protein  25.17 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0419  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  22.93 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  23.85 
 
 		 654 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1455  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.64 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.518126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  23.51 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  27.84 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  24.62 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  21.55 
 
 		 880 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  23.51 
 
 		 1077 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  23.68 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  23.15 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>