More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1388 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  61.98 
 
 
511 aa  645    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  83.13 
 
 
487 aa  832    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  97.53 
 
 
486 aa  960    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  97.33 
 
 
486 aa  957    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
486 aa  983    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  37.99 
 
 
498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  37.98 
 
 
488 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  35.81 
 
 
483 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  33.68 
 
 
485 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  33.74 
 
 
487 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  34.07 
 
 
500 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  33.2 
 
 
497 aa  263  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  34.96 
 
 
489 aa  259  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  33.87 
 
 
474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  34.62 
 
 
482 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  33.88 
 
 
484 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  40.49 
 
 
478 aa  246  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  33.06 
 
 
487 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  31.82 
 
 
516 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 
513 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  35.54 
 
 
547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  29.57 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  35.42 
 
 
374 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  34.88 
 
 
339 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  34.38 
 
 
423 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  33.86 
 
 
334 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  32.98 
 
 
389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  30.46 
 
 
396 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  31.45 
 
 
399 aa  160  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.92 
 
 
420 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  30.04 
 
 
391 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  31.64 
 
 
420 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  31.23 
 
 
408 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  32.32 
 
 
393 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  31.5 
 
 
420 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  27.16 
 
 
393 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  32.86 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  33.92 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.63 
 
 
375 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  30.41 
 
 
427 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  30.77 
 
 
368 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.15 
 
 
429 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  30.77 
 
 
374 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  30.77 
 
 
374 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  28.98 
 
 
365 aa  136  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.73 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  28.96 
 
 
346 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  30.18 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  31.14 
 
 
351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  32.95 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  31.18 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  30.91 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.86 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  29.38 
 
 
349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  30.15 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  31.43 
 
 
335 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  27.56 
 
 
347 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  28.95 
 
 
327 aa  87.4  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  26.49 
 
 
672 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  26.87 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.99 
 
 
892 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  25.16 
 
 
902 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  27.97 
 
 
654 aa  69.3  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  24.58 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  26.87 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  33.5 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
896 aa  67.8  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  27.6 
 
 
898 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  26.05 
 
 
904 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.26 
 
 
333 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  27 
 
 
880 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  29.58 
 
 
657 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  25.16 
 
 
1077 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  29.58 
 
 
657 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  28.94 
 
 
657 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  24.92 
 
 
888 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  23.88 
 
 
863 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1414  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.23 
 
 
322 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  29.26 
 
 
657 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2154  phosphoesterase RecJ domain protein  26.82 
 
 
320 aa  63.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.22 
 
 
873 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  26.01 
 
 
660 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.43 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1715  phosphoesterase domain-containing protein  29.94 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2456  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.43 
 
 
309 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  26.02 
 
 
654 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  23.88 
 
 
863 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  28.94 
 
 
657 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  28.94 
 
 
657 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  28.94 
 
 
657 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  28.94 
 
 
657 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2837  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.43 
 
 
309 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  28.94 
 
 
657 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  25.71 
 
 
669 aa  60.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.43 
 
 
309 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.43 
 
 
309 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1924  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.92 
 
 
310 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00852354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2635  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.92 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.92 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2832  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.92 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>