103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0490 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
339 aa  681    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  52.31 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  48.35 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  48.01 
 
 
423 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  45.57 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  46.5 
 
 
498 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  44.31 
 
 
500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  44.79 
 
 
489 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  43.77 
 
 
547 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  44.01 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  44.13 
 
 
496 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  41.16 
 
 
516 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  44.97 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  43.15 
 
 
487 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  41.39 
 
 
478 aa  239  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  40.43 
 
 
497 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  41.88 
 
 
513 aa  232  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  40.47 
 
 
483 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  44.77 
 
 
487 aa  229  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  45.03 
 
 
484 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  43.79 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  37.23 
 
 
511 aa  206  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 
486 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 
486 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  34.88 
 
 
486 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  35.08 
 
 
487 aa  196  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  36.39 
 
 
389 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  35.85 
 
 
396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  35.16 
 
 
393 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  34.29 
 
 
399 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  32.75 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  32.37 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  31.25 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  32.42 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  31.64 
 
 
360 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  31.41 
 
 
420 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  29.69 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.12 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  31.6 
 
 
366 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  32.24 
 
 
420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  30.33 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  31.21 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  32.11 
 
 
346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  32.45 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.54 
 
 
429 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  29.08 
 
 
374 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  29.08 
 
 
374 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  29 
 
 
368 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  33.33 
 
 
346 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  30.82 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  28.81 
 
 
365 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  28.81 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  28.24 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  32.89 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  29.25 
 
 
335 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  27.52 
 
 
324 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  27.87 
 
 
351 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.06 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.94 
 
 
669 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  24.85 
 
 
898 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.31 
 
 
672 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  26.59 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  24.52 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  23.17 
 
 
892 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.56 
 
 
658 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.57 
 
 
658 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  27.42 
 
 
880 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  22.08 
 
 
652 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  24.73 
 
 
657 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  24.73 
 
 
657 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  22.08 
 
 
652 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  22.42 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  27.36 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  27.93 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  27.93 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  22.01 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.8 
 
 
657 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  25.17 
 
 
657 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  25.17 
 
 
657 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  27.03 
 
 
675 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  23.51 
 
 
684 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  25.17 
 
 
657 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  25.17 
 
 
657 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  25.17 
 
 
657 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  25.17 
 
 
657 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  24.73 
 
 
657 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  25.17 
 
 
657 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  24 
 
 
902 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.35 
 
 
888 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  26.39 
 
 
655 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  25.91 
 
 
904 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  22.15 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.65 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  24.77 
 
 
885 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 
667 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2626  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.49 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0570344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1924  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.07 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00852354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.65 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  23.02 
 
 
669 aa  43.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.65 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>