163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3473 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  100 
 
 
482 aa  960    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  69.61 
 
 
487 aa  666    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  92.39 
 
 
484 aa  848    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  69.61 
 
 
485 aa  671    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  70.72 
 
 
483 aa  677    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  49.36 
 
 
498 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  47.03 
 
 
488 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  43.28 
 
 
500 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  40.67 
 
 
474 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  40.29 
 
 
497 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  39 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  39.11 
 
 
487 aa  326  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  37.34 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  36.84 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  36.03 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  34.82 
 
 
486 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  34.62 
 
 
486 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
486 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  38.15 
 
 
478 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.88 
 
 
487 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  35.16 
 
 
547 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  42.69 
 
 
374 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  30.95 
 
 
511 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  43.79 
 
 
339 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  38.72 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  39.51 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  32.34 
 
 
420 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  33.73 
 
 
396 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  32.13 
 
 
399 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  32.63 
 
 
389 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  33.84 
 
 
393 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  29.38 
 
 
408 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.99 
 
 
420 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  31.99 
 
 
420 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  32.53 
 
 
391 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  30.87 
 
 
427 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  31.07 
 
 
368 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  30.77 
 
 
374 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  30.77 
 
 
374 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  30.35 
 
 
375 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  31.11 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  32.12 
 
 
351 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  32.59 
 
 
393 aa  133  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  30.91 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  28.47 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  29.37 
 
 
341 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  28.04 
 
 
346 aa  123  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  32.23 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  32.71 
 
 
346 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  28.85 
 
 
347 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  29.39 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  28.62 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  28.71 
 
 
420 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  30.45 
 
 
366 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  28.03 
 
 
355 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  28.68 
 
 
360 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  25.59 
 
 
335 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.38 
 
 
327 aa  73.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  35.16 
 
 
234 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  33.86 
 
 
234 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  32.04 
 
 
224 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  35.43 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  35.43 
 
 
334 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  35.43 
 
 
334 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  35.43 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  34.65 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 
220 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  34.45 
 
 
220 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  32.48 
 
 
217 aa  54.7  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  32.81 
 
 
234 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.86 
 
 
330 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  28.99 
 
 
563 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  24.75 
 
 
672 aa  53.5  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  35.59 
 
 
330 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  25.9 
 
 
217 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  31.34 
 
 
216 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  31.34 
 
 
216 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30.51 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  30.53 
 
 
217 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  29.67 
 
 
658 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  31.34 
 
 
216 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0785  inorganic diphosphatase  26.97 
 
 
311 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  29.3 
 
 
352 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  30.3 
 
 
888 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  28.7 
 
 
641 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  28.78 
 
 
227 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  31.01 
 
 
221 aa  50.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  32.33 
 
 
217 aa  50.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.86 
 
 
337 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 
673 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 
215 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.94 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 
215 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.23 
 
 
601 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.71 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  33.33 
 
 
213 aa  50.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.94 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2635  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.94 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.94 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2456  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.94 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>