228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0010 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  49.06 
 
 		 672 aa  656    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  46.52 
 
 		 675 aa  653    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 672 aa  1395    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  42.48 
 
 		 658 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  44.37 
 
 		 685 aa  546  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  42.09 
 
 		 657 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  44.11 
 
 		 658 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  41.35 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  41.35 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  41.35 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  41.35 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  41.81 
 
 		 657 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  41.35 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  41.35 
 
 		 657 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  41.35 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  42.11 
 
 		 657 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  42.11 
 
 		 657 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  40.71 
 
 		 655 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  39.29 
 
 		 655 aa  505  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  39.29 
 
 		 655 aa  505  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  34.44 
 
 		 654 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  35.86 
 
 		 660 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  35.18 
 
 		 669 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  34.67 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  33.69 
 
 		 667 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  33.13 
 
 		 669 aa  343  5e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  31.08 
 
 		 667 aa  323  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  31.28 
 
 		 652 aa  316  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  32.89 
 
 		 652 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  35.9 
 
 		 684 aa  306  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  25.46 
 
 		 653 aa  171  3e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  30.06 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  26.92 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  24.77 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  27.16 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  25.85 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  27.81 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  25.87 
 
 		 318 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.54 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.28 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  24.56 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  25.57 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  25.84 
 
 		 335 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.33 
 
 		 892 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  25.54 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  27.86 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  24.86 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  25.62 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  26.5 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  27.66 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  26.49 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  25.83 
 
 		 486 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 		 486 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  24.05 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  27.3 
 
 		 516 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  25.83 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  24.71 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  25.29 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  27.76 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  25.57 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  26.38 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  27.9 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  25.78 
 
 		 399 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  25.39 
 
 		 323 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.64 
 
 		 320 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  26.67 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  26.06 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  23.86 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  23.2 
 
 		 873 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  25 
 
 		 353 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  29.1 
 
 		 1077 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  23.05 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  27.03 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  23.75 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  26.13 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  25.68 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  24.54 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  25.91 
 
 		 488 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.15 
 
 		 335 aa  63.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  22.78 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  25.73 
 
 		 485 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  23.24 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  24.55 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  25.81 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  25.08 
 
 		 907 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  23.15 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  22.96 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  25.6 
 
 		 315 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  22.87 
 
 		 329 aa  62  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  25.39 
 
 		 351 aa  62  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  25.32 
 
 		 310 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  22.96 
 
 		 317 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  25.15 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  25.96 
 
 		 483 aa  60.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  24.29 
 
 		 355 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  23.08 
 
 		 339 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  24.25 
 
 		 330 aa  60.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>