More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09440 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  100 
 
 		 364 aa  746    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  42.18 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1870  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  26.42 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  27.45 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  24.08 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.15 
 
 		 357 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  29.41 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  23.85 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.64 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  25.8 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.95 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  23.46 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  27.97 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.72 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.72 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.79 
 
 		 336 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.48 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  23.82 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  24.78 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.28 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  23.14 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  23.26 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  23.48 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.21 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.92 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  24.13 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  26.17 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  25.28 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.23 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  23.84 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  24.22 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1322  LacI family response repressor  23.67 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.465092  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27.46 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  25.28 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  25.3 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  23.39 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  24.48 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  26.95 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.45 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  23.15 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.43 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  21.86 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.14 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0222  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.8 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  23.94 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  26.39 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1587  regulatory protein LacI  26.49 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000010083  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  23.5 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  25.59 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  21.39 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  23.33 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  21.59 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  23.59 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  27.73 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  23.41 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  23.23 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  24.65 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  23.13 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.87 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5892  LacI family transcription regulator  26.37 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  23.8 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1600  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.71 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  24.43 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  26.52 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  24.92 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5473  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.31 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433436  normal  0.94425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  24.77 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.92 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.92 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.68 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.92 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  22.32 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  24.83 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.33 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  24.15 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  24.76 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>