More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6897 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 		 672 aa  1377    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.15 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.74 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.99 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.73 
 
 		 539 aa  241  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  32.26 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  32.76 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  32.24 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  35.69 
 
 		 545 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  36.17 
 
 		 546 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.99 
 
 		 550 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  35.33 
 
 		 549 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  31.42 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  35.76 
 
 		 546 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  32.19 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.28 
 
 		 541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.78 
 
 		 536 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.8 
 
 		 567 aa  230  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.9 
 
 		 530 aa  230  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.05 
 
 		 541 aa  230  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.55 
 
 		 542 aa  230  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.66 
 
 		 542 aa  230  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  36.2 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  33.13 
 
 		 551 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  37.85 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.56 
 
 		 548 aa  226  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.19 
 
 		 536 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.49 
 
 		 544 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.32 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 		 543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  36.73 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  36.73 
 
 		 548 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.29 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.49 
 
 		 554 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.34 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  30.8 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 		 543 aa  219  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.74 
 
 		 532 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.9 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.9 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.9 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.32 
 
 		 541 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  35.29 
 
 		 552 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.95 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  41 
 
 		 536 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.52 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  36.12 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.56 
 
 		 540 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.34 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.17 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  28.62 
 
 		 557 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.82 
 
 		 545 aa  211  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.69 
 
 		 560 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  33.92 
 
 		 559 aa  210  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.17 
 
 		 560 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 560 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.56 
 
 		 550 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.89 
 
 		 518 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 		 558 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  39.67 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  30.02 
 
 		 550 aa  207  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  33.07 
 
 		 566 aa  206  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  33.59 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.99 
 
 		 565 aa  206  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  38.67 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  29.83 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  29.3 
 
 		 542 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.58 
 
 		 557 aa  206  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.16 
 
 		 578 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  29.4 
 
 		 551 aa  205  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.16 
 
 		 578 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  31.33 
 
 		 534 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  28.82 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 		 553 aa  204  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 		 555 aa  204  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  27.65 
 
 		 545 aa  203  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  30.5 
 
 		 562 aa  203  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>