74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4088 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 		 838 aa  1628    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  41.49 
 
 		 761 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  41.49 
 
 		 761 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  41.49 
 
 		 761 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  39.69 
 
 		 759 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  27.01 
 
 		 690 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  27.22 
 
 		 691 aa  138  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  27.02 
 
 		 696 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  28.45 
 
 		 670 aa  137  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  26.11 
 
 		 796 aa  137  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  33 
 
 		 690 aa  137  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  27.16 
 
 		 696 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  28.28 
 
 		 687 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  27.48 
 
 		 689 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  27.42 
 
 		 687 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  27.42 
 
 		 687 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  27.59 
 
 		 688 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  26.77 
 
 		 692 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  29.29 
 
 		 700 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  27.65 
 
 		 687 aa  132  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  25.77 
 
 		 690 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  27.75 
 
 		 696 aa  131  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  27.13 
 
 		 687 aa  131  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  29.01 
 
 		 724 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  27.88 
 
 		 692 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  30.29 
 
 		 696 aa  130  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  26.71 
 
 		 693 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  28.61 
 
 		 687 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  27.43 
 
 		 688 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  27.36 
 
 		 687 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  27.29 
 
 		 689 aa  127  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  26.4 
 
 		 680 aa  126  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  27.6 
 
 		 694 aa  126  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  25.33 
 
 		 689 aa  124  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  25.18 
 
 		 731 aa  124  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  25.33 
 
 		 691 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  25.54 
 
 		 699 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  25.27 
 
 		 695 aa  122  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  26.52 
 
 		 688 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  30.13 
 
 		 691 aa  120  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  22.7 
 
 		 829 aa  120  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  29.11 
 
 		 715 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  26.83 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  29.87 
 
 		 689 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  29.87 
 
 		 689 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  24.42 
 
 		 705 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  27.51 
 
 		 712 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  23.86 
 
 		 878 aa  96.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  22.39 
 
 		 732 aa  95.5  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  20.35 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  22.74 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  20.08 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  22.36 
 
 		 690 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 932 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  31.84 
 
 		 252 aa  55.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  31.84 
 
 		 257 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  29.14 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  32.04 
 
 		 251 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  29.14 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  29.14 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  45.59 
 
 		 936 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  29.14 
 
 		 245 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  29.14 
 
 		 245 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  30.69 
 
 		 247 aa  48.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  31.35 
 
 		 254 aa  47.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  24.91 
 
 		 951 aa  47.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  47.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  41.54 
 
 		 903 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  29.11 
 
 		 249 aa  44.3  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>