More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2993 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  37.97 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  34.16 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  34.74 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.75 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.49 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.12 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.82 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.25 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  32.87 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  30.24 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  32.29 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.04 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  28.01 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.85 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.56 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.8 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  29.55 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.62 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  31.36 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  30.47 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.71 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  31.76 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.87 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  30.28 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.65 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  32.31 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.93 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.94 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  30.56 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.25 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  35.78 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  33.04 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  28.07 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.62 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  29.43 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.24 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.64 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  29.96 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.1 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.3 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.82 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.3 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.74 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.3 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  31.65 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  32.2 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  28.72 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.49 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  29.45 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.44 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  25.17 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  28.42 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  28.21 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.76 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.76 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  27.9 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  32.3 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.98 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  28.78 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  31.06 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.1 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  29.9 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.9 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  24.57 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  26.6 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.73 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  28.15 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  28.67 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  31.4 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  31.4 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  27.99 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.56 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  30.1 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  27.46 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  31.01 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.72 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  28.47 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  26.45 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  25.64 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  25.64 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.32 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.57 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  29.73 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.12 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.49 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  27.53 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  24.91 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  28.81 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  30.24 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  32.19 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.94 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  28.22 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.45 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  29.34 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  26.62 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  25.26 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>