More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2956 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.13 
 
 		 1584 aa  871    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45.18 
 
 		 1402 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  44.26 
 
 		 4840 aa  1371    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  32.86 
 
 		 2108 aa  753    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  44.73 
 
 		 3033 aa  895    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  43.81 
 
 		 3158 aa  1157    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  33 
 
 		 2111 aa  770    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.8 
 
 		 5255 aa  1538    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  36.81 
 
 		 2604 aa  1011    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.48 
 
 		 1835 aa  757    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.28 
 
 		 1823 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.97 
 
 		 2719 aa  1312    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.82 
 
 		 2066 aa  1091    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.28 
 
 		 2880 aa  757    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  47.79 
 
 		 3254 aa  963    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  45.6 
 
 		 4080 aa  1330    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  46.94 
 
 		 1071 aa  697    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  50.16 
 
 		 1143 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  45.08 
 
 		 1789 aa  1370    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.95 
 
 		 2551 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 1874 aa  895    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 		 1656 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  42.67 
 
 		 1144 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.79 
 
 		 1587 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.48 
 
 		 1559 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.42 
 
 		 2230 aa  975    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  34.74 
 
 		 2232 aa  972    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  46.69 
 
 		 2376 aa  794    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  38.07 
 
 		 2333 aa  747    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  33.44 
 
 		 2220 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 		 1816 aa  1318    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.94 
 
 		 3493 aa  1444    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  43.78 
 
 		 1616 aa  1137    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  35.2 
 
 		 1349 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 		 1924 aa  918    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  42.6 
 
 		 2081 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  35.64 
 
 		 3111 aa  676    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  47.7 
 
 		 2374 aa  802    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  43.21 
 
 		 4575 aa  1535    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  43.56 
 
 		 2024 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  39.3 
 
 		 1827 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  43.75 
 
 		 2060 aa  1268    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.11 
 
 		 3693 aa  1000    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  42.43 
 
 		 4151 aa  2331    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.59 
 
 		 7110 aa  1654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  43.11 
 
 		 2107 aa  1081    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  43.82 
 
 		 6768 aa  2243    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.21 
 
 		 2085 aa  770    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  43.18 
 
 		 2367 aa  1348    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  44.89 
 
 		 3711 aa  1522    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 2551 aa  695    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  36.01 
 
 		 1909 aa  641    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.35 
 
 		 1354 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  46.07 
 
 		 1548 aa  727    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  45.75 
 
 		 3355 aa  1220    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.4 
 
 		 4111 aa  1287    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  45.79 
 
 		 5154 aa  1360    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  44.53 
 
 		 1955 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.52 
 
 		 3508 aa  1476    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.81 
 
 		 4478 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.52 
 
 		 7210 aa  1763    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  46.62 
 
 		 7279 aa  1667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  44.05 
 
 		 3463 aa  1559    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.11 
 
 		 3693 aa  1000    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  42.43 
 
 		 2126 aa  1313    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 3092 aa  952    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  46.88 
 
 		 3148 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 3874 aa  2255    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 2085 aa  770    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  37.19 
 
 		 3101 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 		 3676 aa  987    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.12 
 
 		 2090 aa  1288    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.93 
 
 		 3696 aa  989    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  32.4 
 
 		 2188 aa  787    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  38.6 
 
 		 1805 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  42.58 
 
 		 4607 aa  1295    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.56 
 
 		 3670 aa  1123    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 		 1828 aa  746    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  44.87 
 
 		 1831 aa  1311    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.26 
 
 		 1087 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52.75 
 
 		 1601 aa  867    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.48 
 
 		 2462 aa  670    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 		 1939 aa  988    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  33.18 
 
 		 2126 aa  766    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  44.84 
 
 		 1602 aa  1085    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.54 
 
 		 3645 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.09 
 
 		 3702 aa  999    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  50 
 
 		 1593 aa  787    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  47.25 
 
 		 3408 aa  1287    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 5400 aa  1516    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.16 
 
 		 2085 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  44.19 
 
 		 3494 aa  1573    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  43.75 
 
 		 4930 aa  1380    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  32.76 
 
 		 2101 aa  743    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 		 3176 aa  1686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 		 3679 aa  946    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  41.78 
 
 		 2113 aa  1109    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.31 
 
 		 1832 aa  883    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  34.99 
 
 		 1806 aa  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  41.73 
 
 		 2847 aa  1134    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>