More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1056 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  100 
 
 		 214 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  72.25 
 
 		 220 aa  325  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  71.63 
 
 		 214 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  70.56 
 
 		 213 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  72.12 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  69.81 
 
 		 230 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  69.52 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  65.24 
 
 		 219 aa  295  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  63.16 
 
 		 214 aa  286  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.29 
 
 		 213 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  59.62 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  54.67 
 
 		 213 aa  267  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  54.21 
 
 		 213 aa  267  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  54.67 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  54.88 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  55.02 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  60.32 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  52.51 
 
 		 240 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  55.61 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  55.34 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  55.05 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  55.34 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.38 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  50.92 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  51.85 
 
 		 226 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  51.89 
 
 		 215 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  53.74 
 
 		 212 aa  230  9e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  51.89 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.95 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  52.71 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  51.83 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  52.31 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  52.38 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  53.11 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  51.17 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  52.4 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  48.83 
 
 		 216 aa  216  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  47.09 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  51.44 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  52.4 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  49.3 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  50.24 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.36 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  49.06 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  48.37 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  49.32 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  49.07 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.37 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  47.74 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.82 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  49.3 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  45.62 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  46.48 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  45.37 
 
 		 232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.37 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.85 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  46.7 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  46.98 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  46.48 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.16 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  48.85 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  51.46 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  45.12 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  47.2 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  47.2 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  47.2 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  45.33 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  45.7 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  42.71 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  44.16 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  44.86 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  43.59 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  43.08 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  44.75 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  45.88 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  43.24 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  41.21 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.63 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  45.2 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  42.71 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  42.5 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  40.3 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  41.5 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  44.57 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  43.23 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  41.29 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  42.49 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  40.1 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  42.49 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  41.15 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  41.15 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  39.8 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  41.62 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  41.03 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  40.3 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.3 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  41.67 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  42.71 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  40.8 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>