More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2013 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  80.26 
 
 		 233 aa  384  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  43.24 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.74 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  41.67 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.65 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  34.3 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.67 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  39.9 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.19 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  36.9 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  36.9 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.5 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  37.89 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  36.26 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  35.52 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  36.61 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  36.61 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.95 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.21 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.64 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  35.8 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  35.8 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.63 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2386  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.12 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00478293 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.41 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  34.59 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.22 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  35.68 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  35.52 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  35.63 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  35.21 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.43 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  35.64 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  34.95 
 
 		 219 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  35.23 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  34.97 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  38.92 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  35.45 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  35.87 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  34.43 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  33.88 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  38.38 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  35.23 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  32.16 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  36 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  37.82 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  33.63 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  34.53 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.1 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.2 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  33.52 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  38.86 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.52 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  35.87 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  34.41 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.17 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  37.3 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  33.88 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1412  HhH-GPD family protein  35.18 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  33.88 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.52 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  34.43 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  34.43 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  34.43 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  33.88 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  33.88 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  31.34 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  33.88 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  33.88 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  35.48 
 
 		 220 aa  95.1  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  35.08 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  34.68 
 
 		 211 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  36.22 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  33.51 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  36.67 
 
 		 287 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.72 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  37.71 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  36.41 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.26 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  33.33 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.59 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  33.88 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  35.16 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  33.88 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  32.13 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  33.33 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  36.22 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  27.73 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  36.22 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>