More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2386 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2386  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 239 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00478293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  50.7 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  49.3 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  50 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  50 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  49.77 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  43.97 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  47.16 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.03 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  48.54 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  45.41 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  44.95 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  45.7 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  46.12 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  47.29 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  47.55 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  44.34 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  46.02 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  47.8 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.02 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  43.11 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.55 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  48.29 
 
 		 359 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  44.13 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  43.72 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.59 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  45.81 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  44.4 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.23 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.81 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.32 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  44.1 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  45.32 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  45.81 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  45.81 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  44.78 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  45.18 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  45.54 
 
 		 212 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  44.78 
 
 		 211 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  43.24 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  42.79 
 
 		 211 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  45.5 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.89 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  46.38 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  45 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  43.78 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  42.93 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  46.76 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  43.78 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  44 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  44.06 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  43.5 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  43.5 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  43 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  45.5 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  45.27 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  44.76 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  44.06 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  44.02 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  43.84 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  42.72 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.57 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  42.72 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.57 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  42.72 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  44.33 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  42.64 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.18 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  43.35 
 
 		 211 aa  178  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  43 
 
 		 215 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  43.84 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  43.78 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  41.09 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.35 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  42.79 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  41.09 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  43 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  43.22 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  44.5 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>