More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2412 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  60.49 
 
 		 300 aa  214  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  58.39 
 
 		 262 aa  205  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  55.9 
 
 		 266 aa  191  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  49.11 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  45.57 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  43.59 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  36.77 
 
 		 155 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  37.25 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  38.22 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  41.83 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  35.26 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  34.97 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  35.67 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  40.13 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  35.98 
 
 		 195 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 		 185 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  36.31 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  35.67 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  34.18 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  42.5 
 
 		 249 aa  72  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  31.06 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  38.61 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  35.37 
 
 		 124 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  34.78 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  35.58 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35.8 
 
 		 351 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  37.63 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.66 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  39.24 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 375 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 375 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  38.27 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  32.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  32.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  32.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.36 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  32.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  40.51 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  34.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.34 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  34.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  34.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  26.88 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  33.75 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  29.57 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  32.2 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 		 370 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 405 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 		 272 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  34.57 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  35.29 
 
 		 279 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  38.37 
 
 		 329 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.8 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  36.71 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 401 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>