More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2188 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  57.52 
 
 
150 aa  178  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  52.26 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  48.03 
 
 
143 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  46.41 
 
 
144 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  43.45 
 
 
151 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  43.45 
 
 
151 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
139 aa  130  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.22 
 
 
160 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.22 
 
 
160 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  40.13 
 
 
158 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  45.33 
 
 
145 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
145 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  45.33 
 
 
145 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.87 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.87 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
148 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
145 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.75 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  39.61 
 
 
145 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 
147 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  38.56 
 
 
149 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.42 
 
 
147 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
152 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
147 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 
147 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  40.26 
 
 
230 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  37.42 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
143 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  46.36 
 
 
147 aa  97.4  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
143 aa  97.1  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  37.09 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.17 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
144 aa  94  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
153 aa  94  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.92 
 
 
136 aa  93.6  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
147 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 
176 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.77 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
143 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
158 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  32.45 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
162 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.52 
 
 
147 aa  87  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.52 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  36.13 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
191 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  38.56 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
139 aa  85.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  32.43 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
147 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
176 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  40 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  33.96 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  34.78 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  41.11 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
204 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  40.37 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>